Las fòrmas ancianas son : Fiscum nostrum cum ecclesia Sancti Saturnini en 897, Joncheriae en 1177, Castrum de Joncariis..., Jonquariis..., Jonqueriis en 1272, 1291, Jonqueyras al sègle XIV, Jonquieras en 1538, Jonquières en 1781. La prononciacion occitana es Jounquièros[1], dins la grafia de l'abat Antòni Savartés, donc [ʒun'kjɛɾɔs].
Lo nom s'explica per la preséncia de joncs [2],[3], possibla dins una comuna tant arida perqué lo vilatge es près d'una val.
Abans la refòrma cantonala de 2014, aplicada en 2015, la comuna èra del canton de Durban; es ara del canton de las Corbièras (burèu centralizator : Fabresan).