O primeiro avião a ser adaptado para o uso militar foi o Do 18D, tendo os modelos Do 18D-1 e Do 18D-2 começando a operar na Luftwaffe no mês de setembro de 1938. Este avião passou a ser utilizado pelos staffeln secundários, onde estes passaram a realizar patrulhas costeiras. Começou-se a utilizar uma versão mais potente no ano de 1939, o Do 18G-1, equipado com dois motores Jumo 205D de 880 HP e equipados com uma metralhadora MG131 de 13mm e um canhão MG151 de 20mm.[2]
Seis Staffeln utilizaram os Do 18 durante a Batalha da França, mas muitos deles foram enviados de volta para a Alemanha para fazer a conversão para Do 18H no mês de junho de 1940, onde foram transformados em aviões de treinamento e Do 18N-1 que foram utilizados para resgates.[2]
Durante o ano de 1940, um total de 49 Do 18Gs foram produzidos, sendo a sua produção encerrada no mês de setembro do mesmo ano, após menos de 100 unidades terem sido fabricadas, destes, 70 eram do modelo Do 18Gs.[2]
Duas unidades ainda continuavam a utilizar os Do 18 durante a Batalha da Grã-Bretanha para resgatar os pilotos que haviam caído na Canal da Mancha. Mais tarde 3 unidades voltaram ao serviço utilizando os Do 18 para missões de reconhecimento no Mar do Norte, onde voaram até o ano de 1942, quando foram substituídos em definitivo pelos modelos Blohm & Voss BV 138.[2]
Versão melhorada com a adição de dois motores Junkers Jumo 205D de 880 cavalos-vapor (647 quilowatts), armado com uma metralhadora MG 131 de 13 milímetros (0,512 polegadas) no nariz e um canhão MG 151 de 20 milímetros (0,787 polegadas) em torre dorsal eletricamente operada. Esta versão teve o contorno do nariz alterado e os sponsons alargados
