Σύμφωνα με μαρτυρίες κατοικείται ήδη από το 1723 και απογραφόταν παλιότερα μαζί με το Βασιλικό[8]. Ως οικισμός αναγνωρίστηκε για πρώτη φορά στις 19/03/1961 και προσαρτήθηκε στην τότε κοινότητα Βασιλικού και έκτοτε αποτελεί τμήμα της σε όλες τις διοικητικές μεταβολές[6][9]. Η περιοχή εμφανίζεται και με την ονομασία "Χάνι Μερκούρη"[10].
Δημογραφική εξέλιξη
Συγκεντρωτικά, η δημογραφική εξέλιξη του οικισμού σύμφωνα με τις εθνικές απογραφές[11][12] είναι η εξής:
↑Να μην συγχέεται με τις Κυδωνιές Χαλανδρίτσας, που βρίσκονται πολύ κοντά.
↑Ο ιστορικός Κώστας Τριανταφύλλου ταυτίζει τις Κυδωνιές με την οικιστική περιοχή Πετσακίτικα της πρώην Κοινότητας Βασιλικού, που αποτέλεσαν αναγνωρισμένο οικισμό μεταξύ 1940-1971. Βλ. Τριανταφύλλου 1995, Τόμος Α', λήμμα Κυδωνίαι.·Τριανταφύλλου 1995, Τόμος Β', λήμμα Πετσακίτικα.