אראגונס נולד במדריד שבספרד. עיקר הקריירה שלו היה באתלטיקו מדריד – הן כמאמן והן כשחקן. הוא היה שחקן בולט בהרכב הקבוצה בשנות ה-60 ובתחילת שנות ה-70 ומיד לאחר פרישתו כשחקן הפך למאמנה. הקבוצה זכתה באליפות הליגה הספרדית ארבע פעמים, הגיעה לגמר גביע אירופה ב-1974 וזכתה בגביע הביניבשתי. בין 1964 לבין 1974 שיחק ארגאונס ב-265 משחקי ליגה במדי אתלטיקו מדריד והבקיע 123 שערים. במדי נבחרת ספרד הופיע 11 פעמים והבקיע שלושה שערים. אראגונס הוא אחד מ-8 שחקנים בלבד אשר קיבלו את תואר "מעמד האגדה" היוקרתי של המארקא, העיתון הנפוץ ביותר בספרד.
בעת משחקו באתלטיקו מדריד זכה אראגונס לכינוי "Zapatones" שמשמעו "מגפיים גדולים". במדיה הבקיע שערים רבים, וב-1970 אף זכה בתואר הפיצ'יצ'י – מלך השערים של הליגה הספרדית (אם כי חלק אותו עם שני שחקנים נוספים). ב-1974 הבקיע את שערה היחיד של קבוצתו בתיקו מול באיירן מינכן בגמר גביע אירופה לאלופות, אך במשחק החוזר הפסידה קבוצתו 4:0.
קריירת אימון
מיד לאחר פרישתו ממשחק פעיל ב-1974 מונה אראגונס להיות מאמנה של אתלטיקו. כבר בעונתו הראשונה כמאמן הוביל את הקבוצה לתואר – הגביע הביניבשתי. על אף שאתלטיקו מדריד לא הייתה אלופת אירופה, היא השתתפה בטורניר עקב סרובה של באיירן מינכן להשתתף בו בעצמה.
בעונת 1975/1976 זכה אראגונס עם הקבוצה בגביע המלך, ובעונה שלאחר מכן זכה באליפות הליגה היחידה שלו כמאמן. בעונת 1979/1980 עזב את אתלטיקו בעקבות ביצועים דלים של הקבוצה.
ב-1981 החל לאמן את ריאל בטיס, אך בעונה שלאחר מכן חזר לאמן את אתלטיקו מדריד. בקדנציה השנייה שלו במועדון, זכו אראגונס והקבוצה בגביע המלך ובסופרקאפ הספרדי – הסופרקאפ היחיד של המועדון – ב-1985. ב-1986 הדריך את הקבוצה עד לגמר גביע המחזיקות בו הפסידה לדינאמו קייב 3:0.
במחזור החמישי של עונת 1987/1988 החליף את טרי ונבלס כמאמן ברצלונה. למרות המצב העגום בו הייתה הקבוצה, הצליח אראגונס להדריכה לצמרת הליגה ולזכייה בגביע המלך.
לאחר שאימן את אספניול בעונת 1990/1991, חזר אראגונס לאתלטיקו לקדנציה שלישית. בקדנציה שנמשכה שנתיים זכה המועדון בגביע נוסף. ב-1993 הצטרף לסביליה, עמה הגיע להישגים נאים במשך שתי עונות נוספות. בעונת 1995/1996 אימן את ולנסיה, בה שיחק אנדוני זוביזארטה ושהגיעה למקום השני בליגה. בקיץ 1996 הצטרף רומאריו לקבוצה, ובעקבות סכסוך בין השניים, שבעקבותיו הועבר רומאריו לקבוצה ברזילאית, פוטר אראגונס בנובמבר אותה שנה.
בעונות הבאות אימן מספר קבוצות, בהן מיורקה, עמה הגיע למקום השלישי בליגה – המקום הגבוה ביותר אליו הגיעה בהיסטוריה. בעונת 2001/2002 אימן את אתלטיקו מדריד בקדנציה הרביעית והאחרונה שלו בה. הוא עזר לה להעפיל לליגה הראשונה.
בסך הכול, שימש אראגונס כמאמן במשך 757 משחקי לה ליגה.
נבחרת ספרד
בשנת 2004 החל אראגונס לאמן את נבחרת ספרד. משחק הבכורה שלו כמאמן הנבחרת היה ב-18 באוגוסט2004 מול נבחרת ונצואלה. ספרד ניצחה 3:2. במוקדמות מונדיאל 2006 העפילה הנבחרת להצלבה מול נבחרת סלובקיה. הנבחרת הספרדית ניצחה אותה בסיכום שני המשחקים 6:2 ועלתה למונדיאל. במונדיאל הגיעה הנבחרת לשמינית הגמר, בו הפסידה לנבחרת צרפת 3:1. למרות רצונו להתפטר, נשאר אראגונס מאמנה של הנבחרת עד סוף הטורניר הבא – יורו 2008.
במוקדמות היורו סיימה הנבחרת כראש בית ו' עם 28 נקודות מתוך 36 אפשריות. בשלב הבתים של הטורניר ניצחה את שלוש משחקיה, כולל ניצחון על אלופת אירופה הקודמת נבחרת יוון. ברבע הגמר ניצחה הנבחרת את נבחרת איטליה בדו-קרב בעיטות עונשין, תוך כדי שהקפטן איקר קסיאס מציג יכולת טובה ומציל ארבע בעיטות בחצי הגמר ניצחה 3:0 את נבחרת רוסיה ובגמר 1:0 את נבחרת גרמניה, ובכך זכתה באליפות אירופה השנייה בתולדותיה. מספר רב של שחקנים נבחרו ל"קבוצת הטורניר", בהם צ'אבי השחקן המצטיין.
בתום הטורניר הוחלף אראגונס על ידי ויסנטה דל בוסקה כמאמן הנבחרת.
באימון נבחרת ספרד ב-2004, תפסו מצלמות טלוויזיה את אראגונס ממריץ את חוסה אנטוניו רייס על ידי אמרות גזעניות כלפי חברו לקבוצה בארסנל, תיירי הנרי: "אמור לחרא השחור הזה שאתה טוב ממנו הרבה יותר. אל תפחד, אמור לו. אמור לו זאת ממני. אתה חייב להאמין בעצמך, אתה טוב יותר מהחרא השחור הזה."
המאורע עורר תגובות רבות בתקשורות הבריטית. לאחר חקירת האירועים, הטילה אופ"א על התאחדות הכדורגל הספרדית קנס בסך 100,000 פרנק שווייצרי (87,000 דולר אמריקני) והזהירה כי כל מאורע עתידי יגרור עונש חמור יותר – הרחקה מטורנירים בינלאומיים, למשל.
כתגובה לכך טען אראגונס בציבור כי אינו גזעני וכי יש לו חברים שחורים. שחקן הנבחרת השחור מרקוס סנה צידד באראגונס ואמר שאינו גזעני כלל אלא אדם נפלא.[1]
שלהי קריירת האימון
ב-5 באוגוסט חתם אראגונס על חוזה לשנתיים כמאמן פנרחבצ'ה הטורקית. בעונתו הראשונה במועדון הוביל את הקבוצה למקום הרביעי ופוטר בתום העונה.