TAF10

TAF10
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2F69, 3M53, 3M54, 3M55, 3M56, 3M57, 3M58, 3M59, 3M5A, 4J7F, 4J7I, 4J83, 4J8O, 4WV4, 5EG2
Ідентифікатори
Символи	TAF10, TAF2A, TAF2H, TAFII30, TATA-box binding protein associated factor 10
Зовнішні ІД	OMIM: 600475 MGI: 1346320 HomoloGene: 86923 GeneCards: TAF10
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • histone acetyltransferase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA polymerase binding; • enzyme binding; • estrogen receptor binding; • thiol-dependent deubiquitinase; • DNA binding; • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • transcription factor TFTC complex; • transcription factor TFIID complex; • perinuclear region of cytoplasm; • клітинне ядро; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • histone deubiquitination; • histone H3 acetylation; • DNA-templated transcription, initiation; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • protein homooligomerization; • regulation of signal transduction by p53 class mediator; • protein deubiquitination; • liver development; • GO:0097285 апоптоз; • регуляція експресії генів; • multicellular organism growth; • regulation of DNA binding; • hepatocyte differentiation; • G1/S transition of mitotic cell cycle; • positive regulation of nucleic acid-templated transcription;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	6881
	24075
	ENSG00000166337
	ENSMUSG00000043866
	Q12962
	Q8K0H5
	NM_006284
	NM_020024
	NP_006275
	NP_064408
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TAF10 (англ. TATA-box binding protein associated factor 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 218 амінокислот, а молекулярна маса — 21 711^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSCSGSGADP	EAAPASAASA	PGPAPPVSAP	AALPSSTAAE	NKASPAGTAG
GPGAGAAAGG	TGPLAARAGE	PAERRGAAPV	SAGGAAPPEG	AISNGVYVLP
SAANGDVKPV	VSSTPLVDFL	MQLEDYTPTI	PDAVTGYYLN	RAGFEASDPR
IIRLISLAAQ	KFISDIANDA	LQHCKMKGTA	SGSSRSKSKD	RKYTLTMEDL
TPALSEYGIN	VKKPHYFT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

Scheer E., Mattei M.-G., Jacq X., Chambon P., Tora L. (1995). Organization and chromosomal localization of the gene (TAF2H) encoding the human TBP-associated factor II 30 (TAFII30). Genomics. 29: 269—272. PMID 8530084 DOI:10.1006/geno.1995.1243
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Brand M., Yamamoto K., Staub A., Tora L. (1999). Identification of TATA-binding protein-free TAFII-containing complex subunits suggests a role in nucleosome acetylation and signal transduction. J. Biol. Chem. 274: 18285—18289. PMID 10373431 DOI:10.1074/jbc.274.26.18285
Kouskouti A., Scheer E., Staub A., Tora L., Talianidis I. (2004). Gene-specific modulation of TAF10 function by SET9-mediated methylation. Mol. Cell. 14: 175—182. PMID 15099517 DOI:10.1016/S1097-2765(04)00182-0
Couture J.-F., Collazo E., Hauk G., Trievel R.C. (2006). Structural basis for the methylation site specificity of SET7/9. Nat. Struct. Mol. Biol. 13: 140—146. PMID 16415881 DOI:10.1038/nsmb1045
Cavusoglu N., Brand M., Tora L., van Dorsselaer A. (2003). Novel subunits of the TATA binding protein free TAFII-containing transcription complex identified by matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry following one-dimensional gel electrophoresis. Proteomics. 3: 217—223. PMID 12601814 DOI:10.1002/pmic.200390030

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11543 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q12962 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.