ARX
ARX
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| ARX, CT121, EIEE1, ISSX, MRX29, MRX32, MRX33, MRX36, MRX38, MRX43, MRX54, MRX76, MRX87, MRXS1, PRTS, aristaless related homeobox |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 300382 MGI: 1097716 HomoloGene: 68998 GeneCards: ARX
|
---|
| Пов'язані генетичні захворювання |
---|
corpus callosum agenesis-abnormal genitalia syndrome, X-linked lissencephaly with abnormal genitalia, intellectual disability, X-linked, with or without seizures, Arx-related, infantile epileptic-dyskinetic encephalopathy, X-linked spasticity-intellectual disability-epilepsy syndrome, non-syndromic X-linked intellectual disability[1] |
| Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
| Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. X: 25 – 25.02 Mb
| Хр. X: 92.33 – 92.34 Mb
|
---|
PubMed search |
[2]
| [3] |
---|
Вікідані | |
ARX (англ. Aristaless related homeobox) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 562 амінокислот, а молекулярна маса — 58 160[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSNQYQEEGC | | SERPECKSKS | | PTLLSSYCID | | SILGRRSPCK | | MRLLGAAQSL |
PAPLTSRADP | | EKAVQGSPKS | | SSAPFEAELH | | LPPKLRRLYG | | PGGGRLLQGA |
AAAAAAAAAA | | AAAAATATAG | | PRGEAPPPPP | | PTARPGERPD | | GAGAAAAAAA |
AAAAAWDTLK | | ISQAPQVSIS | | RSKSYRENGA | | PFVPPPPALD | | ELGGPGGVTH |
PEERLGVAGG | | PGSAPAAGGG | | TGTEDDEEEL | | LEDEEDEDEE | | EELLEDDEEE |
LLEDDARALL | | KEPRRCPVAA | | TGAVAAAAAA | | AVATEGGELS | | PKEELLLHPE |
DAEGKDGEDS | | VCLSAGSDSE | | EGLLKRKQRR | | YRTTFTSYQL | | EELERAFQKT |
HYPDVFTREE | | LAMRLDLTEA | | RVQVWFQNRR | | AKWRKREKAG | | AQTHPPGLPF |
PGPLSATHPL | | SPYLDASPFP | | PHHPALDSAW | | TAAAAAAAAA | | FPSLPPPPGS |
ASLPPSGAPL | | GLSTFLGAAV | | FRHPAFISPA | | FGRLFSTMAP | | LTSASTAAAL |
LRQPTPAVEG | | AVASGALADP | | ATAAADRRAS | | SIAALRLKAK | | EHAAQLTQLN |
ILPGTSTGKE | | VC |
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Turner G., Partington M., Kerr B., Mangelsdorf M., Gecz J. (2002). Variable expression of mental retardation, autism, seizures, and dystonic hand movements in two families with an identical ARX gene mutation. Am. J. Med. Genet. 112: 405—411. PMID 12376946 DOI:10.1002/ajmg.10714
Примітки
Див. також
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
| (2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
| (3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
| (4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
| (0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|
|
|