HIVEP3
HIVEP3
Ідентифікатори
Символи
HIVEP3 , Hivep3, 2900056N03Rik, A130075N07, AI848000, E030045D18Rik, KBP-1, KBP1, Rc, Schnurri-3, Shn3, Zas3, ZNF40C, human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3, Kappa Recognition Component (Krc), KRC, HIVEP zinc finger 3
Зовнішні ІД
OMIM : 606649 MGI: 106589 HomoloGene: 7803 GeneCards: HIVEP3
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• цитоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес
• multicellular organism development • skeletal muscle cell differentiation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 сигнальна трансдукція • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 1: 41.51 – 42.04 Mb
Хр. 4: 119.59 – 120 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
HIVEP3 (англ. Human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 406 амінокислот , а молекулярна маса — 259 465[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MDPEQSVKGT KKAEGSPRKR LTKGEAIQTS VSSSVPYPGS GTAATQESPA
QELLAPQPFP GPSSVLREGS QEKTGQQQKP PKRPPIEASV HISQLPQHPL
TPAFMSPGKP EHLLEGSTWQ LVDPMRPGPS GSFVAPGLHP QSQLLPSHAS
IIPPEDLPGV PKVFVPRPSQ VSLKPTEEAH KKERKPQKPG KYICQYCSRP
CAKPSVLQKH IRSHTGERPY PCGPCGFSFK TKSNLYKHRK SHAHRIKAGL
ASGMGGEMYP HGLEMERIPG EEFEEPTEGE STDSEEETSA TSGHPAELSP
RPKQPLLSSG LYSSGSHSSS HERCSLSQSS TAQSLEDPPP FVEPSSEHPL
SHKPEDTHTI KQKLALRLSE RKKVIDEQAF LSPGSKGSTE SGYFSRSESA
EQQVSPPNTN AKSYAEIIFG KCGRIGQRTA MLTATSTQPL LPLSTEDKPS
LVPLSVPRTQ VIEHITKLIT INEAVVDTSE IDSVKPRRSS LSRRSSMESP
KSSLYREPLS SHSEKTKPEQ SLLSLQHPPS TAPPVPLLRS HSMPSAACTI
STPHHPFRGS YSFDDHITDS EALSHSSHVF TSHPRMLKRQ PAIELPLGGE
YSSEEPGPSS KDTASKPSDE VEPKESELTK KTKKGLKTKG VIYECNICGA
RYKKRDNYEA HKKYYCSELQ IAKPISAGTH TSPEAEKSQI EHEPWSQMMH
YKLGTTLELT PLRKRRKEKS LGDEEEPPAF ESTKSQFGSP GPSDAARNLP
LESTKSPAEP SKSVPSLEGP TGFQPRTPKP GSGSESGKER RTTSKEISVI
QHTSSFEKSD SLEQPSGLEG EDKPLAQFPS PPPAPHGRSA HSLQPKLVRQ
PNIQVPEILV TEEPDRPDTE PEPPPKEPEK TEEFQWPQRS QTLAQLPAEK
LPPKKKRLRL AEMAQSSGES SFESSVPLSR SPSQESNVSL SGSSRSASFE
RDDHGKAEAP SPSSDMRPKP LGTHMLTVPS HHPHAREMRR SASEQSPNVS
HSAHMTETRS KSFDYGSLSL TGPSAPAPVA PPARVAPPER RKCFLVRQAS
LSRPPESELE VAPKGRQESE EPQPSSSKPS AKSSLSQISS AATSHGGPPG
GKGPGQDRPP LGPTVPYTEA LQVFHHPVAQ TPLHEKPYLP PPVSLFSFQH
LVQHEPGQSP EFFSTQAMSS LLSSPYSMPP LPPSLFQAPP LPLQPTVLHP
GQLHLPQLMP HPANIPFRQP PSFLPMPYPT SSALSSGFFL PLQSQFALQL
PGDVESHLPQ IKTSLAPLAT GSAGLSPSTE YSSDIRLPPV APPASSSAPT
SAPPLALPAC PDTMVSLVVP VRVQTNMPSY GSAMYTTLSQ ILVTQSQGSS
ATVALPKFEE PPSKGTTVCG ADVHEVGPGP SGLSEEQSRA FPTPYLRVPV
TLPERKGTSL SSESILSLEG SSSTAGGSKR VLSPAGSLEL TMETQQQKRV
KEEEASKADE KLELVKPCSV VLTSTEDGKR PEKSHLGNQG QGRRELEMLS
SLSSDPSDTK EIPPLPHPAL SHGTAPGSEA LKEYPQPSGK PHRRGLTPLS
VKKEDSKEQP DLPSLAPPSS LPLSETSSRP AKSQEGTDSK KVLQFPSLHT
TTNVSWCYLN YIKPNHIQHA DRRSSVYAGW CISLYNPNLP GVSTKAALSL
LRSKQKVSKE TYTMATAPHP EAGRLVPSSS RKPRMTEVHL PSLVSPEGQK
DLARVEKEEE RRGEPEEDAP ASQRGEPARI KIFEGGYKSN EEYVYVRGRG
RGKYVCEECG IRCKKPSMLK KHIRTHTDVR PYVCKHCHFA FKTKGNLTKH
MKSKAHSKKC QETGVLEELE AEEGTSDDLF QDSEGREGSE AVEEHQFSDL
EDSDSDSDLD EDEDEDEEES QDELSRPSSE APPPGPPHAL RADSSPILGP
QPPDAPASGT EATRGSSVSE AERLTASSCS MSSQSMPGLP WLGPAPLGSV
EKDTGSALSY KPVSPRRPWS PSKEAGSRPP LARKHSLTKN DSSPQRCSPA
REPQASAPSP PGLHVDPGRG MGALPCGSPR LQLSPLTLCP LGRELAPRAH
VLSKLEGTTD PGLPRYSPTR RWSPGQAESP PRSAPPGKWA LAGPGSPSAG
EHGPGLGLDP RVLFPPAPLP HKLLSRSPET CASPWQKAES RSPSCSPGPA
HPLSSRPFSA LHDFHGHILA RTEENIFSHL PLHSQHLTRA PCPLIPIGGI
QMVQARPGAH PTLLPGPTAA WVSGFSGGGS DLTGAREAQE RGRWSPTESS
SASVSPVAKV SKFTLSSELE GGDYPKERER TGGGPGRPPD WTPHGTGAPA
EPTPTHSPCT PPDTLPRPPQ GRRAAQSWSP RLESPRAPTN PEPSATPPLD
RSSSVGCLAE ASARFPARTR NLSGEPRTRQ DSPKPSGSGE PRAHPHQPED
RVPPNA
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , поліморфізм, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
Література
Hicar M.D., Liu Y., Allen C.E., Wu L.-C. (2001). Structure of the human zinc finger protein HIVEP3: molecular cloning, expression, exon-intron structure, and comparison with paralogous genes HIVEP1 and HIVEP2. Genomics . 71 : 89—100. PMID 11161801 DOI :10.1006/geno.2000.6425
Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res . 7 : 273—281. PMID 10997877 DOI :10.1093/dnares/7.4.271
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші