KLF1
KLF1
Ідентифікатори
Символи
KLF1 , CDAN4, EKLF, HBFQTL6, INLU, Kruppel-like factor 1 (erythroid), Kruppel like factor 1, EKLF/KLF1
Зовнішні ІД
OMIM : 600599 MGI: 1342771 HomoloGene: 4785 GeneCards: KLF1
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес
• GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • erythrocyte differentiation • cellular response to peptide • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • maternal process involved in female pregnancy • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 19: 12.88 – 12.89 Mb
Хр. 8: 85.63 – 85.63 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
KLF1 (англ. Kruppel like factor 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 362 амінокислот , а молекулярна маса — 38 221[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MATAETALPS ISTLTALGPF PDTQDDFLKW WRSEEAQDMG PGPPDPTEPP
LHVKSEDQPG EEEDDERGAD ATWDLDLLLT NFSGPEPGGA PQTCALAPSE
ASGAQYPPPP ETLGAYAGGP GLVAGLLGSE DHSGWVRPAL RARAPDAFVG
PALAPAPAPE PKALALQPVY PGPGAGSSGG YFPRTGLSVP AASGAPYGLL
SGYPAMYPAP QYQGHFQLFR GLQGPAPGPA TSPSFLSCLG PGTVGTGLGG
TAEDPGVIAE TAPSKRGRRS WARKRQAAHT CAHPGCGKSY TKSSHLKAHL
RTHTGEKPYA CTWEGCGWRF ARSDELTRHY RKHTGQRPFR CQLCPRAFSR
SDHLALHMKR HL
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , ацетилювання .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
Bieker J.J. (1996). Isolation, genomic structure, and expression of human erythroid Kruppel-like factor (EKLF). DNA Cell Biol . 15 : 347—352. PMID 8924208 DOI :10.1089/dna.1996.15.347
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Zhang W., Bieker J.J. (1998). Acetylation and modulation of erythroid Krueppel-like factor (EKLF) activity by interaction with histone acetyltransferases. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A . 95 : 9855—9860. PMID 9707565 DOI :10.1073/pnas.95.17.9855
Singleton B.K., Burton N.M., Green C., Brady R.L., Anstee D.J. (2008). Mutations in EKLF/KLF1 form the molecular basis of the rare blood group In(Lu) phenotype. Blood . 112 : 2081—2088. PMID 18487511 DOI :10.1182/blood-2008-03-145672
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші