NR1I3
NR1I3
|
---|
|
| Ідентифікатори
|
---|
Символи
| NR1I3, CAR, CAR1, MB67, nuclear receptor subfamily 1 group I member 3 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 603881 MGI: 1346307 HomoloGene: 3759 GeneCards: NR1I3
|
---|
| Реагує на сполуку |
---|
5β-pregnane-3,20-dione, клотримазол, (RS)-meclizine[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001105 transcription coactivator activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • steroid hormone receptor activity • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • transcription factor binding • nuclear receptor coactivator activity • signaling receptor activity
|
---|
Клітинна компонента |
• цитоплазма • гіалоплазма • нуклеоплазма • цитоскелет • клітинне ядро • RNA polymerase II transcription regulator complex
|
---|
Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • steroid hormone mediated signaling pathway • androgen receptor signaling pathway • intracellular receptor signaling pathway • multicellular organism development • диференціація клітин
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | | Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
| Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 1: 161.23 – 161.24 Mb
| Хр. 1: 171.04 – 171.05 Mb
|
---|
PubMed search |
[2]
| [3] |
---|
Вікідані | |
NR1I3 (англ. Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 352 амінокислот, а молекулярна маса — 39 942[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MASREDELRN | | CVVCGDQATG | | YHFNALTCEG | | CKGFFRRTVS | | KSIGPTCPFA |
GSCEVSKTQR | | RHCPACRLQK | | CLDAGMRKDM | | ILSAEALALR | | RAKQAQRRAQ |
QTPVQLSKEQ | | EELIRTLLGA | | HTRHMGTMFE | | QFVQFRPPAH | | LFIHHQPLPT |
LAPVLPLVTH | | FADINTFMVL | | QVIKFTKDLP | | VFRSLPIEDQ | | ISLLKGAAVE |
ICHIVLNTTF | | CLQTQNFLCG | | PLRYTIEDGA | | RVSPTVGFQV | | EFLELLFHFH |
GTLRKLQLQE | | PEYVLLAAMA | | LFSPDRPGVT | | QRDEIDQLQE | | EMALTLQSYI |
KGQQRRPRDR | | FLYAKLLGLL | | AELRSINEAY | | GYQIQHIQGL | | SAMMPLLQEI |
CS |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
| (2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
| (3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
| (4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
| (0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|
|
|