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La ligne TEOL sera connectée au réseau TER Auvergne-Rhône-Alpes à la gare de Lyon-Jean-Macé et à la gare d'Alaï. À la gare de Lyon-Perrache, elle sera connectée de surcroît avec les trains grandes lignes et les trains à grande vitesse. Elle sera aussi connectée aux lignes A et B du métro, aux lignes T1 et T2 du tramway ainsi qu'à plusieurs lignes de bus.
Pour rejoindre Alaï depuis Lyon, deux options sont présentées à la concertation :
une connexion directe en voie double entre Alaï et Ménival via la rue Joliot Curie (option a) ;
un tracé desservant Libération avec une voie double entre Ménival et Libération et une boucle à voies uniques (dites « voies dissociées » par l'avenue de Gaulle dans le sens nord-sud et le chemin de la Raude dans le sens sud-nord) de Libération à Alaï (option b).
Après la station Ménival, le tramway doit passer en souterrain. Deux options de tracé de connexion à la Presqu’île et aux infrastructures de tramway existantes pour une desserte sans correspondance des métros A et B sont présentées à la concertation :
passage par le cours Suchet pour une connexion au niveau de la station Place des Archives ;
passage par la rue Montrochet pour une connexion au niveau de la station Hôtel de Région - Montrochet.