La ligne de Bordeaux à Sète est inaugurée le par la Compagnie des chemins de fer du Midi et du Canal latéral à la Garonne et sa gare, installée plus au Nord et nommée Gare de Cette - Midi, deviendra la seule gare voyageur de la ville à partir de 1858, dès que la jonction des lignes des deux compagnies ferroviaires sera effective[3].
Cette gare et ses emprises sont toujours en service et correspondent à la gare actuelle, tandis que la gare du PLM sera rapidement dédiée au service marchandise et transformée en faisceau ferroviaire pour la desserte du Port de commerce de Sète.
Service des voyageurs
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Gare[4] SNCF, elle dispose d'un bâtiment voyageurs, avec guichet, ouvert tous les jours. Elle est équipée d'automates pour l'achat de titres de transport. C'est une gare « Accès Plus » disposant d'aménagements et de services pour les personnes à la mobilité réduite.