En tant que chef d'état-major général, le , il crée une « commission de dégagement » chargée de mener à terme l'épuration des cadres militaires commencée par le général Cochet. Il demande à la commission chargée du classement des officiers, présidée par le général Guillot, de juger d'abord de leur attitude patriotique entre 1940 et 1945, ensuite de leur aptitude professionnelle et enfin de leur potentiel militaire. Cependant, les listes dressées par la commission entrent en discordance avec celles établies par le ministre Edmond Michelet : celui-ci veut conserver au moins 80 officiers exclus par la commission Guillot et dont les compétences lui paraissent indispensables. Bouscat se montre solidaire de Guillot mais, après son départ en septembre 1946, son successeur le général Paul Gérardot réintègre les 80 « dégagés »[6]. Comme chef d'état-major aérien, en 1946, une polémique oppose Bouscat au général Juin, chef d'état-major de l'armée de terre : Bouscat demande davantage de moyens financiers pour la reconstitution des forces aériennes alors que Juin réclame la priorité pour les forces terrestres et voudrait limiter l'aviation à un rôle d'appui tactique. Bouscat proteste contre un partage des tâches qui renoncerait à l'idée de supériorité aérienne et réduirait l'armée de l'Air à des missions de « police coloniale ». La commission présidée par le général Guyot arbitre en faveur des thèses de Juin[7],[8].
Le plan d'armement de cinq ans présenté par Bouscat le doit s'adapter à ces exigences. Il est centré sur le MD 315, appareil de liaison et de transport adapté aux missions coloniales, qui doit relayer les Ju 52 récupérés sur la Luftwaffe : le MD 315 sera livré à 137 exemplaires. Un programme de chasseurs à réaction est mis à l'étude sans débouché immédiat[8].
Bouscat est Grand-croix de la Légion d'Honneur (décret du 16 juin 1945)[9], et le devient titulaire de la Médaille militaire[10].
Ouvrages
René Bouscat, Étude sommaire sur l'aviation marchande française, Éditions Ailes de France, 1942 (ASINB0018HIFGK)
René Bouscat, Quête malhabile, Éditions du Scorpion, 1961 (ASINB0014Y6NZW)
René Bouscat, De Gaulle - Giraud, dossier d'une mission, Flammarion, 1967 (ISBN978-2080600066)
↑Olivier Forcade (dir.), Éric Duhamel (dir.) et Philippe Vial (dir.), Militaires en République (1870-1962), Publications de la Sorbonne, 1999, p. 680-681[2]
↑Maurice Vaïsse, L'armée française dans la guerre d'Indochine (1946-1954), Complexe, 2000, p. 340 [3]