三根山藩（日语：三根山藩／みねやまはん Mineyama-han */?）是日本越後國藩原郡（日语：蒲原郡）三根山的藩[註 1]，為長岡藩的支藩（日语：支藩）[2]:9，文久3年2月18日（1863年4月5日）創藩，明治3年（1870年）改稱峰岡藩（日语：峰岡藩／みねおかはん Mineoka-han */?）[註 2]，明治4年7月14日（1871年8月29日）廢藩。石高是11,000石，藩廳是三根山陣屋[3]，藩校（日语：藩校）是入德館[4]，人口是1,976戶11,040人[3]。武家屋敷（日语：武家屋敷）方面，江戶藩邸（日语：江戸藩邸）上屋敷設於飯倉片町[註 3]，下屋敷設於廣尾祥雲寺（日语：祥雲寺 (渋谷区)）前[6]。
寬永11年5月21日（1634年6月16日），牧野定成（日语：牧野定成）獲其父長岡藩藩主牧野忠成（日语：牧野忠成 (越後長岡藩初代)）分知（日语：分知）6,000石，領地是藩原郡（日语：蒲原郡）17村，最初由和納村的割元（日语：割元）等負責管治[註 4]，定成根據《寬政重修諸家譜》記載在當時便為旗本寄合席。萬治元年10月7日（1658年11月2日），定成死去，由其弟牧野忠清（日语：牧野忠清）繼位。天和2年5月29日（1682年7月4日），忠清之子牧野忠貴（日语：牧野忠貴）繼位。元祿3年4月19日（1690年5月27日），忠貴被處以逼塞（日语：逼塞）[2]:8-10。
寶永3年（1706年）11月，旗本秋月種封（日语：秋月種封）次子作為忠貴養子而繼位，即牧野忠列（日语：牧野忠列）。享保13年3月25日（1728年5月3日），忠列在外櫻田獲賜宅邸[註 5]，享保16年4月15日（1731年5月20日）焚毀，元文元年（1736年）8月在三田田島町獲賜宅邸以及普請（日语：普請）金1,500兩。延享3年4月5日（1746年5月24日），忠列四子牧野忠知（日语：牧野忠知）繼位。寶曆元年（1751年），三田田島町邸交換至靈南坂上的麻布市兵衛邸。同年，忠知由於負責火消而移居至赤坂門外[註 6]。兩處宅邸均分別在明和9年2月29日和寬政4年7月21日（1772年4月1日和1792年9月7日）毀於火災[2]:10-12。
天明5年3月29日（1785年5月7日），忠知長子牧野忠義（日语：牧野忠義）繼位。享和2年10月8日（1802年11月3日），忠義就任甲府勤番（日语：甲府勤番），負責把守甲府城。忠義在當地發生大火後陷入飢荒時，曾經擅自打開公儀（日语：公儀）米倉救災，此舉受到百姓贊頌而獲奉為神明。享和3年10月13日（1803年11月26日），忠義長子牧野忠救繼位。文化3年5月21日（1806年7月7日），他就任為駿府加番（日语：加番）。文化15年3月14日（1818年4月19日），他移居至位於中澀谷羽澤的宅邸[2]:12-13。
文政7年12月27日（1825年2月14日），松平乘寬（日语：松平乗寛）次子作為忠救養子而繼位，即牧野忠衛。文政10年6月20日（1827年7月13日），忠衛移居至飯倉片町。天保5年11月4日（1834年12月4日），奧平昌高（日语：奥平昌高）次子作為忠衛養子而繼位，即牧野忠直。嘉永7年10月7日（1854年11月26日），松平乘美（日语：松平乗美）次子作為忠直養子而繼位，即牧野忠興。安政4年12月27日（1858年2月10日），五島盛成（日语：五島盛成）侄子作為忠興養子而繼位，即牧野忠泰（日语：牧野忠泰）[2]:7、14-15。
文久3年2月18日（1863年4月5日），忠泰獲江戶幕府調整石高至11,000石而創立三根山藩。元治2年2月2日（1865年2月27日），忠泰獲任命為大坂加番。慶應4年（1868年）5月上旬，三根山藩跟隨長岡藩參加奧羽越列藩同盟。同年5月26日（7月15日），三根山藩與出羽庄內藩一同出兵至寺泊（日语：寺泊町）與新政府軍（日语：官軍）交戰。7月29日（9月15日），三根山藩向新政府軍投降，並且奉命討伐庄內藩[8][2]:16-17。
明治元年12月9日（1869年1月21日），三根山藩被下令轉封（日语：転封），地方則未定，引發領民反對，並且請願要求撤回。明治2年10月25日（1869年11月28日），轉封地定為信濃國伊那郡（日语：伊那郡）內49村約15,555石，三根山藩的領地則交由水原縣（日语：水原県）接管。同年12月4日（1870年1月5日），在東京府知事壬生基修（日语：壬生基修）和參議前原一誠（日语：前原一誠）等人的協助下，轉封命令獲撤回，相對地藩領平野村和下山村內500石則被收回[註 7]，並且交由水原縣接管。明治3年（1870年）[註 2]，三根山藩的日語讀音由於與丹後峰山藩相同而更名為峰岡藩[2]:185-190。明治4年7月14日（1871年8月29日），廢藩置縣[1]。