323-тя бойова ескадра особливого призначення була сформована у серпні 1942 року й складалася з трьох транспортних авіаційних груп, проте не мала штабного підрозділу. Основним призначення ескадри було перекидання повітрям вантажів, боєприпасів, особового складу тощо до формувань вермахту, що билися на півночі Африки. У травні 1943 року після розгрому групи армій «Африка» ескадра була розформована, а її підрозділи передані до складу 5-ї транспортної ескадри