Najopasnije područje za nas jeste Istra. Ne znamo ništa o sudbini italijanskih snaga na tom prostoru. Primetili smo da je Titu ovo područje najvažnije.[2]
– Ratni dnevnik Vrhovne komande Vermahta od 17. septembra 1943.
Gušenje ustanka u Istri Nemci su smatrali nužnim preduslovom za odbranu granica Rajha. Nemački 2. SS oklopni korpus protiv sebe je imao snage Operativnog štaba za Istru, odnosno dve brigade i dva partizanska odreda. Snage Vermahta posedovale nesrazmernu brojčanu i tehničku nadmoć (raspolagale su sa 30.000 ljudi i 95 tenkova, 41 jurišnih topova, 26 oklopnih lovaca, i 6 teških samohodnih topova). Hitlerovo naređenje za operaciju preneto trupama 24. septembra 1943. godine glasi:
Slovensko-komunistički ustanak u Istri se mora sa bezobzirnom okrutnošću ugušiti, a ustanici iskorijeniti i strijeljati. Svako ko se upusti u borbu protiv nas s oružjem u ruci, mora se odmah strijeljati, bez obzira da li je riječ o Slovencima, bivšim talijanskim vojnicima ili ustanicima drugog etničkog porijekla.
Pristup i odnos snaga mora biti takav da je zajamčen veliki uspjeh i da se većina formacija oslobodi za druge zadatke. Slovenski živalj ne smije više nikad predstavljati opasnost.[3]
Hitler izdao zapovest da se pod svaku cenu uništi slovenački komunistički ustanički pokret u Istri. Svaki ustanik, bez obzira koje nacionalnosti, ima da se na licu mesta strelja.[2]
– Ratni dnevnik Vrhovne komande Vermahta od 22. septembra 1943.
Budući da se radilo o novoformiranim partizanskim jedinicama bez borbenog iskustva, Nemci su u roku od dva dana uspeli da razbiju glavne istarske partizanske jedinice. Do 1. oktobra trajale su nemačke akcije čišćenja terena, a zatim je tižište dejstava preneto na Gorski kotar, gde se na udaru našla 13. primorsko-goranska divizija. Prema nemačkim izveštajima, partizanske snage imale su 4.096 i 6.850 zarobljenih. Prema procenama jugoslovenskih autora, snage Operativnog štaba za Istru pretrpele su veoma teške gubitke od oko 2.000 poginulih. Pored toga, Nemci su ubili i oko 2.000 civila.
Ljudstvo razbijenih istarskih jedinica delom se probilo u Gorski kotar, gde je uključeno u jedinice Trinaeste divizije NOVJ, a delom se pasiviziralo. Tokom narednih nedelja rukovodstvo NOP-a u Istri uspelo je obnoviti borbene jedinice u manjem obimu, tako da je krajem novembra raspolagalo sa 13 četa jačine od 15 do 50 boraca. Otpor u Istri sistematski je jačao, tako da je, pored više hiljada boraca koji su pristupili jedinicama u Lici i Gorskom Kotaru, u julu 1944. Operativni štab za Istru raspolagao sa 4.864 borca pa je u avgustu 1944. formirana 43. istarska divizija sa tri brigade.
↑NARA, T354, Roll 606, frame no. 001007. (njem."Der Führer hat heute noch einmal befohlen, dass die slowenisch- kommunistische Aufstandsbewegung in Istrien mit rücksichtsloser Härte niederzuschlagen und die Aufständigen auszurotten sind. Wer mit der Waffe in der Hand in Kampf gegen uns gestellt wird, ist sofort zu erschiessen, gleichgültig, ob es sich um Slowenen, ehemalige italienische Soldaten oder um Aufständische anderer Volksstämme handelt. Ansatz und Kräftebenessung müssen derart sein, dass mit Sicherheit ein grosser Erfolg erzielt wird und damit die Masse der Verbände für andere Aufgaben frei werden. Die slowenische Bevölkerung darf nach der Aktion keine Gefahr sehr für uns bilden.")