Cette liste commentée recense la mammalofaune en Estonie. Elle répertorie les espèces de mammifères estoniens actuels et celles qui ont été récemment classifiées comme éteintes (à partir de l'Holocène, depuis donc 11 700 ans av. J.‑C.)[Note 1]. Cette liste comporte 84 espèces réparties en dix ordres et 25 familles, dont une est « en danger critique d'extinction », un autre est « en danger », deux sont « vulnérables » et cinq sont « quasi menacées » (selon les critères de la liste rouge de l'UICN au niveau mondial).
Elle contient au moins huit espèces introduites sur ce territoire, qui sont plus ou moins bien acclimatées. Il peut contenir aussi dans cette liste des animaux non reconnus par la liste rouge de l'UICN (un mammifère ici) et ils sont classés en « non évalué » : cela étant dû notamment au manque de données et à des espèces domestiques, disparues ou éteintes avant le XVIe siècle. Il n'existe pas en Estonie d'espèces et de sous-espèces de mammifères endémiques.
Les statuts de conservation utilisés par la liste rouge de l'UICN mondiale sont[1] :
(Homme moderne)
Linnaeus, 1758
(Lièvre d'Europe)
Pallas, 1778
(Lièvre variable)
(Castor d'Eurasie)
(Réintroduit)[5],[Note 3]
(Siciste des bouleaux)
(Pallas, 1779)
(Campagnol terrestre)
(Linnaeus, 1758)
(Campagnol nordique)
(Pallas, 1776)
(Disparu)[8],[Note 4]
(Campagnol agreste)
(Linnaeus, 1761)
(Campagnol des champs)
(Pallas, 1778)
(Campagnol d'Ondrias)
Miller, 1908
(Campagnol souterrain)
(de Sélys Longchamps, 1836)
(Campagnol roussâtre)
Schreber, 1780
(Rat musqué)
(Linnaeus, 1766)
(Introduit)[15],[Note 5]
(Mulot rayé)
(Pallas, 1771)
(Mulot à collier)
(Melchior, 1834)
(Mulot pygmée)
(Pallas, 1811)
(Rat des moissons)
(Souris grise)
(Introduit)[20],[21]
(Rat surmulot)
(Berkenhout, 1769)
(Introduit)[22]
(Rat noir)
(Introduit)[23]
(Lérot commun)
(Muscardin)
(Polatouche de Sibérie)
(Écureuil roux)
(Hérisson d'Europe occidentale)
(Hérisson des Balkans)
Barrett-Hamilton, 1900
(Crocidure des jardins)
(Disparu)[8]
(Crossope de Miller)
Cabrera, 1907
(Crossope aquatique)
(Pennant, 1771)
(Musaraigne carrelet)
(Musaraigne masquée)
Laxmann, 1788
(Musaraigne naine)
Zimmermann, 1780
(Musaraigne pygmée)
Linnaeus, 1766
(Taupe d'Europe)
(Murin de Brandt)
(Eversmann, 1845)
(Murin des marais)
(Boie, 1825)
(Murin de Daubenton)
(Kuhl, 1817)
(Murin à moustaches)
(Murin de Natterer)
(Sérotine de Nilsson)
(Keyserling & Blasius, 1839)
(Noctule commune)
(Schreber, 1774)
(Pipistrelle de Nathusius)
(Pipistrelle commune)
(Pipistrelle pygmée)
(Leach, 1825)
(Barbastelle d'Europe)
(Oreillard roux)
(Sérotine bicolore)
(Baleine à bosse)
(Borowski, 1781)
(Grand Dauphin commun)
(Montagu, 1821)
(Lagénorhynque à rostre blanc)
(Gray, 1846)
(Bélouga)
(Marsouin commun)
(Bison d'Europe)
(Disparu)[59]
(Taurin)
(Disparu)[61]
(Mouflon oriental)
(Introduit)[62]
(Élan)
(Chevreuil européen)
(Renne)
(Disparu)[66]
(Cerf élaphe)
(Cerf sika)
Temminck, 1838
(Peut-être non acclimaté)[69],[Note 7]
(Daim européen)
(Introduit)[71]
(Sanglier d'Eurasie)
(Cheval)
(Disparu)[73]
(Chacal doré)
(Loup gris)
(Chien viverrin)
(Gray, 1834)
(Introduit)[78]
(Renard roux)
(Ours brun)
(Loutre commune)
(Glouton)
(Disparu, puis erratique)[82],[83],[Note 8]
(Fouine)
(Erxleben, 1777)
(Martre des pins)
(Blaireau européen)
(Vison d'Europe)
(Réintroduit)[87]
(Hermine)
(Belette d'Europe)
(Putois d'Europe)
(Vison d'Amérique)
(Schreber, 1777)
(Phoque gris)
(Fabricius, 1791)
(Phoque du Groenland)
(Disparu)[94],[Note 10]
(Phoque veau marin)
(Disparu, puis erratique)[96],[94],[Note 11]
(Phoque annelé)
(Schreber, 1775)
(Chat sauvage)
Schreber, 1777
(Lynx boréal)
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