Villabuena del Puente liegt am Rand der Kastilischen Hochebene(Meseta Iberica) in einer Höhe von ca. 700 m. Die Provinzhauptstadt Zamora ist gut 29 km (Fahrtstrecke) in westnordwestlicher Richtung entfernt; bis nach Salamanca sind es gut 50 km in südsüdwestlicher Richtung. Das gemäßigte Kontinentalklima wird nur selten vom Atlantik beeinflusst; Regen (ca. 429 mm/Jahr) fällt vorwiegend im Winterhalbjahr.[2]
