У JetBlue было несколько инцидентов, связанных с её самолетами, хотя ни один из них не привёл к разрушению самолёта или гибели людей.
Самые известные:
21 сентября 2005 года пилоты Airbus A320, выполнявшие рейс 292 из Бербанка в Нью-Йорк обнаружили неисправность передней стойки шасси сразу после взлета. Самолёт провёл три часа в воздухе, чтобы сжечь топливо, а затем совершил аварийную посадку в Международном аэропорту Лос-Анджелеса. Единственные видимые повреждения самолета при посадке — разрушение шасси. Из людей никто не пострадал[5].
9 марта 2013 года в международном аэропортуНью-Йорка самолёт авиакомпании «JetBlue Airways» столкнулся с самолётом авиакомпании «Air India». Из людей никто не пострадал. Оба самолёта получили повреждения[6].