요리노부는 로닌(浪人)들의 대다수를 자기 가신으로 불러들여, 유이 쇼세쓰(由井正雪)와의 관계를 막부에게 의심받은 적도 있었다. 그러나 요리노부의 손자인 5대 번주 도쿠가와 요시무네가 8대 쇼군으로 취임하기에 이르렀고, 오히려 막부와의 관계가 가장 밀접한 번이 되었다. 13대 번주 도쿠가와 요시토미는 11대 쇼군 도쿠가와 이에나리의 손자이기도 했지만, 14대 쇼군 도쿠가와 이에모치로 즉위하였고, 기슈 번주 출신의 두 번째 쇼군이 되었다. 8대 요시무네 이후 14대 이에모치까지의 역대 쇼군은 모두 기슈 번주 계통이었다.
기슈 번은 메이지 2년(1869년) 판적봉환 이후 와카야마 번으로 정식 명칭이 바뀌었고, 메이지 4년(1871년)의 폐번치현으로 와카야마현이 되었으나, 기이 국의 동부와 이세국 내의 기슈번 영지는 미에현에 편입되었다.
번청의 위치를 기준으로 하고 있지만, 다른 지방으로 이전한 번도 있다. 순번은 『삼백 번 보신 전쟁 사전(三百藩戊辰戦争事典)』에 따른다. 메이지 시대의 변화: ★=신설、●=폐지、○=이전・개칭、▲=본번에 병합. 소괄호()안은 이전・개칭・병합된 후의 번명이다. 소괄호가 없는 것들은 현에 편입된다.