Questa pagina raccoglie le informazioni riguardanti il Varese Football Club nelle competizioni ufficiali della stagione 1990-1991.
Nella stagione 1990-1991 il Varese ha disputato il girone A del campionato di Serie C1. Con 30 punti in classifica si è piazzato in quindicesima posizione ed è retrocesso in Serie C2.