Des fouilles archéologiques ont été réalisées entre autres sur les lieux d'habitations de l'âge de pierre de Tuukkala, Visulahti, Orijärvi et de Kenkävero.
Les tumulus de l'âge de pierre sont ceux de Sairila, Otava, Vatila et d'Otrala.
Pendant la guerre des gourdins(fi) (1596-1597), on assassinera plus de 200 paysans à Kenkävero dans la paroisse de Mikkeli en 1597.
Pendant la guerre russo-suédoise (1788-1790) la bataille de Porrassalmi(fi) se déroulera en 1789 à quelques kilomètres de Mikkeli. Les troupes suédo-finlandaises y gagneront une bataille défensive face aux troupes russes plus puissantes.
En 2001, la ville de Mikkeli a fusionné avec les municipalités rurales de Mikkeli et d'Anttola. Au , les communes de Ristiina et Suomenniemi ont fusionné avec la ville de Mikkeli.
Les plus grands employeurs industriels de Mikkeli sont actifs dans l'industrie graphique, l'industrie alimentaire, la transformation du bois et les textiles hospitaliers.
Il n'y a plus de ligne aérienne desservant Mikkeli depuis octobre 2005.
Cependant, la ville se situe sur une des branches du chemin de fer de Savonie, et la gare de Mikkeli est donc bien desservie par le rail (3 h 15 d'Helsinki, 1 h 40 de Kuopio).
Sans changer de train, on peut se rendre de Mikkeli à Helsinki via Kouvola et Lahti, et de Mikkeli jusqu'à Rovaniemi via Kajaani et Oulu.
Jusqu'aux élections municipales de 2008 le conseil municipal de Mikkeli est composé de 80 élus.
Le président du conseil municipal est Olli Nepponen (kokoomus).
↑(fi) Heikki Myyryläinen, « Kivikautiset löydöt », Mikkeli.fi, Mikkeli-seura, (consulté le )
↑(en) Jukka Korpela, The World of Ladoga : Society, Trade, Transformation and State Building in the Eastern Fennoscandian Boreal Forest Zone C. 1000-1555, Münster, Lit Verlag, , 400 p. (ISBN978-3-8258-1633-9, lire en ligne)
↑(en) Thomas Hall, Planning and Urban Growth in Nordic Countries (Planning, History and Environment Series), Routledge, , 256 p. (ISBN978-0-203-45130-4)
↑(en) Anthony F. Upton, The Finnish Revolution : 1917-1918, University of Minnesota Press, , 608 p. (ISBN978-1-4529-1239-4)