Le premier match officiel du Guatemala est joué à Tegucigalpa, le , contre le Honduras et se solde par un score sans appel de 10 buts à 1, ce qui constitue aussi la plus large victoire de l'équipe. Vingt-cinq ans plus tard, le pays devient membre de la FIFA, en 1946. La plus large défaite des Chapines a eu lieu à San José, contre le Costa Rica, le avec un score très lourd de 9 buts à 1.
Le Guatemala participe pour la première fois aux éliminatoires de la Coupe du monde à l'occasion de l'édition 1958. Il est battu par le Costa Rica et les Antilles néerlandaises au 1er tour. En 1961, la Fédération guatémaltèque s'affilie à la CONCACAF.
À la Gold Cup 1991, le Guatemala est battu au 1er tour par le Costa Rica (0-2) et les États-Unis (0-3) mais bat Trinité-et-Tobago (1-0, but de Luis Espel). L'année suivante, lors des qualifications à la World Cup USA 1994, les Chapines sont éliminés dès le 1er tour par le Honduras (0-0 puis 2-0).
À la Gold Cup 2000, l’équipe du Guatemala perd au 1er tour contre Trinité-et-Tobago (2-4, buts de Guillermo Ramírez et de Juan Carlos Plata) mais tient en échec le Mexique (1-1, but d’Erick Miranda).
Lors de la Coupe UNCAF des Nations 2001 disputée au Honduras, en phase de poule, l’équipe entraînée par le sélectionneur uruguayenJulio César Cortés concède deux matchs nuls contre le Belize (3-3) et le Costa Rica (1-1) et se qualifie pour la 2e phase. Au tour final, après un piètre match nul contre le Salvador (0-0), le Guatemala bat le Panama (3-1) et le Costa Rica (2-0), ce qui lui permet de terminer 1er et de gagner le tournoi en se qualifiant au passage pour la Gold Cup 2002. Le meilleur buteur guatémaltèque de la compétition est Freddy García avec 3 buts.
Des éliminatoires 2002 à la Coupe UNCAF 2009
Lors des qualifications à la Coupe du monde 2002, l’équipe du Guatemala termine 2e lors du 1er tour, derrière le Salvador, devant le Belize puis bat en barrages Antigua-et-Barbuda. Lors du 2e tour le Guatemala termine 2e ex-æquo derrière les États-Unis, devant la Barbade à égalité avec le Costa Rica. Le Costa Rica et le Guatemala finirent à égalité dans tous les critères, un fait rare (buts marqués, buts encaissés, même différence de buts, pas de vainqueur lors des confrontations directes). Donc un match de barrage sur terrain neutre fut joué à Miami, le , pour déterminer lequel d'entre les deux accéderait au tour final. Malheureusement, le Guatemala perdit ce barrage contre le Costa Rica (2-5).
À la Gold Cup 2002, le Guatemala perd à deux reprises contre le Salvador (0-1) et le Mexique (1-3, but de Juan Carlos Plata) au 1er tour. À la Gold Cup 2003, il fait un match nul contre la Colombie (1-1, but de Carlos Ruiz) et perd contre la Jamaïque (0-2) au 1er tour. Durant la Gold Cup 2005, la sélection guatémaltèque fait match nul contre l’Afrique du Sud (1-1, but de Gonzalo Romero) et perd contre la Jamaïque (3-4, triplé de Carlos Ruiz) et contre le Mexique (0-4). À la Gold Cup 2007, le Guatemala bat le Salvador (1-0, but de José Manuel Contreras), fait match nul contre Trinité-et-Tobago (1-1, but de Carlos Ruiz) et perd contre les États-Unis (0-1) au 1er tour, puis est battu en quarts de finale par le Canada (0-3).
Durant les éliminatoires de la Coupe du monde 2006, le Guatemala élimine le Suriname au 1er tour, termine deuxième au second tour, derrière le Costa Rica, mais devant le Honduras et le Canada. Lors du dernier tour l'équipe termine 5e sur 6, devant le Panama. Malgré une bonne campagne (11 points glanés) cela s'avéra insuffisant pour se hisser à la 4e place qualificative à un barrage avec le 5e de l'AFC. Finalement ce fut Trinité-et-Tobago qui, via ce barrage, s'octroya le dernier billet pour le mondial allemand.
Lors des qualifications à la Coupe du monde 2010, le Guatemala bat Sainte-Lucie au second tour, puis est reversé dans le groupe des États-Unis, Cuba et Trinité-et-Tobago. Mais le Guatemala terminera 3e de ce groupe derrière les États-Unis et Trinité-et-Tobago (déjà bourreau du Guatemala en qualifications pour la Coupe du monde 2006) et rata ainsi sa qualification.
La Coupe UNCAF des nations 2013 se solda par un échec cuisant (2 nuls face à des adversaires moins huppés comme le Belize (0-0) et le Nicaragua (1-1) puis un nouveau match nul face au pays hôte, le Costa Rica (1-1)). Une défaite lors du match de barrage pour la 5e place face au Panama (1-3) confirma l'élimination du Guatemala pour le tournoi continental (Gold Cup 2013). Ever Almeida quitta la sélection sous le feu des critiques. Remplacé par un sélectionneur intérimaire, Víctor Hugo Monzón, qui a perdu 3 des 4 matches qu'il a dirigé, il a lui-même été débarqué. La Fédération guatémaltèque annonça le nom du Chilien Sergio Pardo pour un intérim d'un seul match[2], le face au Japon, qui s'est soldé par une défaite 0-3.
Le , la Fédération guatemaltèque intronisa l'Argentin Iván Sopegno comme nouveau sélectionneur national. Ses débuts furent prometteurs puisqu'il mena le Guatemala en finale de la Coupe UNCAF des nations 2014 après trois victoires de suite au 1er tour face au Salvador (2-1), au Belize (2-1) et au Honduras (2-0). Cependant les Chapines s'inclinèrent devant le Costa Rica (1-2) en finale. Malgré tout cette bonne campagne leur permit à la fois de faire un bond de 77 places au classement FIFA (57e au mois de )[3] et surtout de se qualifier pour la Gold Cup 2015. La suite est moins glorieuse puisque le Guatemala arrache in extremis sa qualification au 3e tour préliminaire du Mondial 2018 (0-0 puis 1-0 face aux Bermudes) avant de succomber dès le 1er tour de la Gold Cup 2015 après deux défaites face à Trinité-et-Tobago (1-3) et Cuba (0-1), malgré un bon match nul obtenu en infériorité numérique contre le Mexique (0-0)[4]. En , le Guatemala doit encore batailler pour éliminer Antigua-et-Barbuda à l'occasion du 3e tour préliminaire des éliminatoires à la Coupe du monde 2018, en remontant une défaite initiale à St. John's (2-1 sur l'ensemble des deux matchs).
Malgré cette qualification pour le 4e tour des éliminatoires 2018, Sopegno quitte la sélection du Guatemala en [5]. Il est remplacé un mois plus tard par Walter Claverí[6], qui frappe un grand coup pour son premier match puisque le Guatemala bat les États-Unis, le , pour la première fois en match de qualification de la Coupe du monde[7]. La suite est moins heureuse car les Guatémaltèques ne peuvent franchir ce tour préliminaire en terminant à la troisième place du groupe, derrière les Américains et Trinité-et-Tobago, équipe qui les avait battus 1-2 au Stade Mateo Flores lors de la 1re journée, résultat qui élimina in fine le Guatemala.
Le , le Guatemala, dont la fédération est en conflit avec la FIFA, est suspendu de toute compétition internationale[8]. Quelques jours plus tard, le sélectionneur Walter Claverí, qui avait été prolongé jusqu'en , est obligé de quitter son poste[9]. Cette suspension a des conséquences sportives fâcheuses puisque le Guatemala est exclu de la Copa Centroamericana 2017 et par ricochet de la Gold Cup 2017 dont la qualification est déterminée par les résultats obtenus lors de la première compétition[10].
Depuis 2018
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Le , la FIFA décide de lever la suspension internationale pesant sur le Guatemala, privé depuis 18 mois de toute compétition internationale[11].
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