فریدون ناصری در ۱۷ تیر سال ۱۳۸۴ پس از مدتی بستریبودن بهعلت نارسایی قلبی در بیمارستان مدائن تهران درگذشت.[۵]
کتابخانه فریدون ناصری
پانزده سال پس از درگذشت فریدون ناصری، سجاد پورقناد سردبیر ژورنال گفتگوی هارمونیک با کمک نیما ناصری فرزند فریدون ناصری، آثار به جای مانده از او را در کتاب خانه اش مورد ارزیابی قرار دادند و در این کنکاش، پارتیتورهای زیادی از آثار منتشر شده و منتشر نشده او به همراه تعداد زیادی، نامه، سند، دست نوشته و... از فریدون ناصری و دیگر هنرمندان موسیقی ایران کشف شد. [۶][۷]