Рибосомний білок S27a
Рибосомний білок S27a
Наявні структури
PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
2KTF , 2L0F , 2L0T , 2XK5 , 3AXC , 3NHE , 3NOB , 3PHW , 3TBL , 4UG0 , 4V6X , 5AJ0 , 4R62 , 5FLX , 4UJD , 4KZZ , 4UJC , 3J7P , 4KZY , 4D5L , 3J7R , 4D61 , 4KZX , 4UJE , 5A2Q
Ідентифікатори
Символи
RPS27A , CEP80, HEL112, S27A, UBA80, UBC, UBCEP1, UBCEP80, ribosomal protein S27a
Зовнішні ІД
OMIM : 191343 MGI: 1925544 HomoloGene: 37715 GeneCards: RPS27A
Онтологія гена
Молекулярна функція
• зв'язування з іоном металу • structural constituent of ribosome • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • protein tag • ubiquitin protein ligase binding
Клітинна компонента
• цитоплазма • endocytic vesicle membrane • гіалоплазма • мембрана • клітинне ядро • рибосома • myelin sheath • cytosolic small ribosomal subunit • ядерце • екзосома • клітинна мембрана • нуклеоплазма • small ribosomal subunit • endosome membrane • міжклітинний простір • мітохондріальна зовнішня мембрана • endoplasmic reticulum quality control compartment • везикула • endoplasmic reticulum membrane • host cell
Біологічний процес
• DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway • interstrand cross-link repair • nucleotide-excision repair, DNA damage recognition • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • regulation of type I interferon production • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • Fc-epsilon receptor signaling pathway • endosomal transport • global genome nucleotide-excision repair • NIK/NF-kappaB signaling • G2/M transition of mitotic cell cycle • stress-activated MAPK cascade • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • macroautophagy • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • nucleotide-excision repair, DNA gap filling • viral transcription • error-free translesion synthesis • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane • JNK cascade • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • nucleotide-excision repair, DNA incision • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • вроджений імунітет • Сигнальний шлях Notch • regulation of mRNA stability • protein polyubiquitination • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • virion assembly • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • negative regulation of type I interferon production • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway • GO:0046795 intracellular transport of virus • GO:0019067 viral life cycle • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • error-prone translesion synthesis • MAPK cascade • fibroblast growth factor receptor signaling pathway • ion transmembrane transport • glycogen biosynthetic process • positive regulation of apoptotic process • translational initiation • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • translesion synthesis • transcription-coupled nucleotide-excision repair • T cell receptor signaling pathway • MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of signal transduction by p53 class mediator • positive regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway • Wnt signaling pathway • nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • Біосинтез білків • rRNA processing • ERBB2 signaling pathway • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • nucleotide-excision repair, preincision complex assembly • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • згортання білків • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • Убіквітин-залежний протеоліз • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • entry of bacterium into host cell • трансмембранний транспорт • regulation of necroptotic process • membrane organization • endoplasmic reticulum mannose trimming • cellular iron ion homeostasis • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • protein targeting to peroxisome • cytokine-mediated signaling pathway • modification-dependent protein catabolic process • interleukin-1-mediated signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 2: 55.23 – 55.24 Mb
Хр. 11: 29.5 – 29.5 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
Рибосомний білок S27a (англ. Ribosomal protein S27a ) – білок, який кодується геном RPS27A, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 156 амінокислот , а молекулярна маса — 17 965[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MQIFVKTLTG KTITLEVEPS DTIENVKAKI QDKEGIPPDQ QRLIFAGKQL
EDGRTLSDYN IQKESTLHLV LRLRGGAKKR KKKSYTTPKK NKHKRKKVKL
AVLKYYKVDE NGKISRLRRE CPSDECGAGV FMASHFDRHY CGKCCLTYCF
NKPEDK
Цей білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів , рибосомних білків .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
Література
Adams S.M., Sharp M.G., Walker R.A., Brammar W.J., Varley J.M. (1992). Differential expression of translation-associated genes in benign and malignant human breast tumours . Br. J. Cancer . 65 : 65—71. PMID 1370760 DOI :10.1038/bjc.1992.12
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Schlesinger D.H., Goldstein G. (1975). Molecular conservation of 74 amino acid sequence of ubiquitin between cattle and man. Nature . 255 : 423—424. PMID 1128706 DOI :10.1038/255423a0
Huang F., Kirkpatrick D., Jiang X., Gygi S.P., Sorkin A. (2006). Differential regulation of EGF receptor internalization and degradation by multiubiquitination within the kinase domain. Mol. Cell . 21 : 737—748. PMID 16543144 DOI :10.1016/j.molcel.2006.02.018
Okumura F., Hatakeyama S., Matsumoto M., Kamura T., Nakayama K. (2004). Functional regulation of FEZ1 by the U-box-type ubiquitin ligase E4B contributes to neuritogenesis. J. Biol. Chem . 279 : 53533—53543. PMID 15466860 DOI :10.1074/jbc.M402916200
Komander D. (2009). The emerging complexity of protein ubiquitination. Biochem. Soc. Trans . 37 : 937—953. PMID 19754430 DOI :10.1042/BST0370937
Примітки
Див. також