EIF3L

EIF3L
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3J8B, 3J8C
Ідентифікатори
Символи	EIF3L, EIF3EIP, EIF3S11, EIF3S6IP, HSPC021, HSPC025, MSTP005, eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L
Зовнішні ІД	MGI: 2386251 HomoloGene: 9380 GeneCards: EIF3L
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • translation initiation factor activity • RNA binding Клітинна компонента • ядерце • мембрана • fibrillar center • гіалоплазма • нуклеоплазма • цитоплазма • eukaryotic translation initiation factor 3 complex • eukaryotic 43S preinitiation complex • eukaryotic 48S preinitiation complex Біологічний процес • translational initiation • viral translational termination-reinitiation • Біосинтез білків • formation of cytoplasmic translation initiation complex • cytoplasmic translational initiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51386	223691
Ensembl	ENSG00000100129	ENSMUSG00000033047
UniProt	Q9Y262	Q8QZY1
RefSeq (мРНК)	NM_001242923 NM_016091 NM_001363785	NM_145139
RefSeq (білок)	NP_001229852 NP_057175 NP_001350714	NP_660121
Локус (UCSC)	Хр. 22: 37.85 – 37.89 Mb	Хр. 15: 78.96 – 78.98 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EIF3L (англ. Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 564 амінокислот, а молекулярна маса — 66 727^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSYPADDYES		EAAYDPYAYP		SDYDMHTGDP		KQDLAYERQY		EQQTYQVIPE
VIKNFIQYFH		KTVSDLIDQK		VYELQASRVS		SDVIDQKVYE		IQDIYENSWT
KLTERFFKNT		PWPEAEAIAP		QVGNDAVFLI		LYKELYYRHI		YAKVSGGPSL
EQRFESYYNY		CNLFNYILNA		DGPAPLELPN		QWLWDIIDEF		IYQFQSFSQY
RCKTAKKSEE		EIDFLRSNPK		IWNVHSVLNV		LHSLVDKSNI		NRQLEVYTSG
GDPESVAGEY		GRHSLYKMLG		YFSLVGLLRL		HSLLGDYYQA		IKVLENIELN
KKSMYSRVPE		CQVTTYYYVG		FAYLMMRRYQ		DAIRVFANIL		LYIQRTKSMF
QRTTYKYEMI		NKQNEQMHAL		LAIALTMYPM		RIDESIHLQL		REKYGDKMLR
MQKGDPQVYE		ELFSYSCPKF		LSPVVPNYDN		VHPNYHKEPF		LQQLKVFSDE
VQQQAQLSTI		RSFLKLYTTM		PVAKLAGFLD		LTEQEFRIQL		LVFKHKMKNL
VWTSGISALD		GEFQSASEVD		FYIDKDMIHI		ADTKVARRYG		DFFIRQIHKF
EELNRTLKKM		GQRP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до факторів ініціації, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біосинтез білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Morris-Desbois C., Rety S., Ferro M., Garin J., Jalinot P. (2001). The human protein HSPC021 interacts with Int-6 and is associated with eukaryotic translation initiation factor 3. J. Biol. Chem. 276: 45988—45995. PMID 11590142 DOI:10.1074/jbc.M104966200
• Yuan X., Zhao J., Zentgraf H., Hoffmann-Rohrer U., Grummt I. (2002). Multiple interactions between RNA polymerase I, TIF-IA and TAF(I) subunits regulate preinitiation complex assembly at the ribosomal gene promoter. EMBO Rep. 3: 1082—1087. PMID 12393749 DOI:10.1093/embo-reports/kvf212
• Kolupaeva V.G., Unbehaun A., Lomakin I.B., Hellen C.U.T., Pestova T.V. (2005). Binding of eukaryotic initiation factor 3 to ribosomal 40S subunits and its role in ribosomal dissociation and anti-association. RNA. 11: 470—486. PMID 15703437 DOI:10.1261/rna.7215305
• Masutani M., Sonenberg N., Yokoyama S., Imataka H. (2007). Reconstitution reveals the functional core of mammalian eIF3. EMBO J. 26: 3373—3383. PMID 17581632 DOI:10.1038/sj.emboj.7601765
• Poyry T.A., Kaminski A., Connell E.J., Fraser C.S., Jackson R.J. (2007). The mechanism of an exceptional case of reinitiation after translation of a long ORF reveals why such events do not generally occur in mammalian mRNA translation. Genes Dev. 21: 3149—3162. PMID 18056426 DOI:10.1101/gad.439507

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18138 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]
4. UniProt, Q9Y262 (англ.) . Архів оригіналу за 9 березня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 22

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»