Rafael Jambeiro recebeu status de município pela lei estadual n.º 4.447, de 9 de maio de 1985, com território desmembrado do município de Castro Alves.[6] Este município obteve emancipação em 9 de maio de 1985 e, após a promulgação do ato de emancipação pela Assembleia Legislativa da Bahia, seguiram-se as primeiras eleições municipais na localidade que resultaram na eleição de Marciano Serra, como seu primeiro prefeito[7].
O município de Rafael Jambeiro possui uma estrutura político-administrativa composta pelo Poder Executivo, chefiado por um Prefeito eleito por sufrágio universal, o qual é auxiliado diretamente por secretários municipais nomeados por ele, e pelo Poder Legislativo, institucionalizado pela Câmara Municipal de Rafael Jambeiro, órgão colegiado de representação dos munícipes que é composto por 11 vereadores também eleitos por sufrágio universal.[8]