Pracuje na stanowisku profesora uczelni w Zakładzie Prawa Karnego macierzystego wydziału, gdzie od 1 września 2017 pełni funkcję kierownika katedry[1][3][4]. Ukończył aplikację prokuratorską w Prokuraturze Wojewódzkiej w Poznaniu. Ponadto jest byłym ekspertem Instytutu Sobieskiego[5], członkiem Fundacji Uniwersyteckich Poradni Prawnych[6] oraz przedstawicielem wojewody wielkopolskiego w Radzie Kuratorów Fundacji Zakłady Kórnickie[7]. Od 2013 pełni funkcję zastępcy redaktora naczelnego Humanistycznych Zeszytów Naukowych – Prawa Człowieka. Od 2017 pełni funkcję wiceprzewodniczącego Rady Naukowej Instytutu Ekspertyz Sądowych im. Jana Sehna w Krakowie[4].
Został członkiem Rady Naukowej kwartalnika „Prawo i Więź”[8].
Na posiedzeniu Narodowej Akademii Nauk Prawnych Ukrainy (Національна академія правових наук України), które odbywało się 28 sierpnia 2020 r. w Połtawie, w uznaniu zasług naukowych oraz współpracy z Akademią został jednogłośnie wybrany do grona Akademii jako jej członek zagraniczny. Wniosek przedstawił prezes Akademii prof. Oleksandr Petryshyn. Prof. Justyn Piskorski jest pierwszym Polakiem w tym gronie[9][10].
Wybrany 15 września 2017 do Trybunału Konstytucyjnego, mimo iż stanowisko w Trybunale Konstytucyjnym wówczas było już obsadzone przez prof. Krzysztofa Ślebzaka, który oczekuje na złożenie ślubowania. 18 września Justyn Piskorski złożył ślubowanie przed prezydentem RP[11].
22 października 2020 jako sprawozdawca był w składzie orzekającym Trybunału Konstytucyjnego, w którym TK wydał wyrok o niezgodności z Konstytucją Rzeczypospolitej Polskiej wykonywania aborcji z powodu ciężkiego i nieodwracalnego upośledzenia płodu albo nieuleczalnej choroby zagrażającej jego życiu[12]. Wyrok Trybunału doprowadził do licznych protestów przeciwko zmianie przepisów aborcyjnych na ogólnokrajową skalę[13][14][15]. W następstwie protestów został poproszony przez współpracowników o rezygnację z kierowania Zakładem Prawa Karnego[16].
