L'11 agosto 2005 a Pontecagnano nasce la Salernitana Calcio 1919 in seguito alla radiazione dai professionisti della Salernitana Sport. La nuova società aderisce al Lodo Petrucci e partecipa al campionato di livello immediatamente inferiore a quello della precedente società di Aliberti, la Serie C1, non partecipa alla Coppa Italia.
Nella stagione 2005-2006 si riparte da Marco Ambrosio, Lorenzo Prisco, Rijat Shala, Salvatore Fresi (nuovo capitano poi andato via per incomprensioni con l'allenatore) oltre al ritorno a Salerno dell'attaccante Ciro De Cesare: sono questi i nomi che anche dopo il fallimento avvenuto nella precedente stagione decidono di restare ed aderire al nuovo progetto guidato dal presidente Antonio Lombardi, uno dei soci fondatori. Sono questi i nomi con cui il nuovo sodalizio cerca di stabilire un legame con la storia e la tradizione del calcio salernitano.
La precedente Salernitana riparte invece, per pochi mesi in Terza Categoria ed alcuni tifosi (tra cui quelli del gruppo Ultras Plaitano) optano di seguire l'altra squadra che disputa il campionato a partire da novembre con una selezione di giovanissimi calciatori (che immediatamente si ritrovano in testa alla classifica), anche se l'esperienza dura poco in quanto la vecchia società viene messa in liquidazione nel gennaio 2006 ed in seguito è radiata da ogni competizione ufficiale, con i risultati ottenuti in campionato che vengono annullati.
Nel frattempo prosegue il campionato di Serie C1 della nuova Salernitana Calcio, che al termine del torneo con il quinto posto a 52 punti, riesce a cogliere il diritto di partecipare ai Play-off, venendo eliminata però dal Genoa nella doppia semifinale: 2-1 per i granata a Salerno; stesso risultato a favore dei grifoni nella gara di ritorno, disputata al Luigi Ferraris di Genova. In tal modo i genoani si qualificano per la finale, in virtù del miglior piazzamento ottenuto in campionato con 56 punti. La nuova Salernitana ha potuto così solo sfiorare l'immediato ritorno in Serie B.
Al termine della stagione le squadre ad essere promosse in cadetteria sono: lo Spezia (vincitore del campionato), ed il Genoa promosso a seguito dei Play-off.