Vive tutelato dal 1999 e sottoposto a scorta dal 2003 dopo la scoperta del progetto di un attentato ai suoi danni organizzato dal clan dei Casalesi. È stato, per quattro legislature, consulente della Commissione parlamentare antimafia, partecipando anche alla redazione della relazione sulla criminalità organizzata di tipo camorristico in Campania. È presidente onorario del presidio di Libera di Giugliano in Campania (NA), dedicato a Filomena Morlando, vittima innocente di camorra.
È stato sostituto procuratore presso il tribunale di Napoli, dove si è occupato principalmente di criminalità economica, fino al 1999, quando è entrato nella Direzione distrettuale antimafia della Procura di Napoli, di cui ha fatto parte fino al 2007. Assegnato all'area del casertano, si è occupato delle indagini sul clan camorristico dei Casalesi, riferite anche nel noto best seller di Roberto Saviano, Gomorra, riuscendo a ottenere la condanna all'ergastolo dei più importanti capi di quel gruppo fra cui Francesco Schiavone, detto Sandokan, Francesco Bidognetti, detto Cicciotto 'e Mezzanott, Walter Schiavone, detto Walterino, Augusto La Torre, Mario Esposito e numerosi altri. Si è occupato anche delle indagini sulle infiltrazioni nel settore dei rifiuti e delle infiltrazioni dei clan casertani all'estero, in particolare in Scozia, dove è stata individuata una vera e propria filiale del clan La Torre di Mondragone dedita al reinvestimento in attività imprenditoriali e commerciali di proventi illeciti, in Germania, Romania e Ungheria, dove esponenti del clan Schiavone durante la latitanza si erano stabiliti e avevano acquistato beni immobili e imprese. Ha curato il filone di indagini che hanno riguardato gli investimenti del gruppo Zagaria a Parma e Milano facendo condannare per associazione camorristica un importante immobiliarista di Parma.
Dal 2007 ha lavorato presso l'Ufficio del Massimario della Suprema Corte di Cassazione, dove ha coordinato il settore penale. Nel novembre 2013 ha presentato al CSM la richiesta di nomina a procuratore aggiunto presso la Procura del neonato Tribunale Napoli nord, segno evidente della volontà di tornare all'attività inquirente.[3] Nel 2014 al 2019 è stato in aspettativa dalla magistratura a causa dell'incarico di presidente dell'ANAC.[4]
Il 24 marzo 2012 gli viene conferita la cittadinanza onoraria del comune di Cortona, e il 15 ottobre dello stesso anno ottiene quella del comune di Agerola. Il 21 marzo 2013, nel corso della "Giornata della memoria e dell'impegno in ricordo delle vittime delle mafie", gli viene conferita la cittadinanza onoraria del comune di Sessa Aurunca.
Il 18 giugno 2013 viene nominato, dal Presidente del ConsiglioEnrico Letta, componente della task force per l'elaborazione di proposte in tema di lotta alla criminalità organizzata[6].
Il 27 marzo 2014 il presidente del Consiglio Matteo Renzi propone Cantone quale presidente dell'Autorità nazionale anticorruzione, nomina confermata dalle commissioni affari costituzionali di Camera e Senato all'unanimità[7].
Dopo la seconda ondata di arresti per la realizzazione di Expo 2015, il governo ha affidato la sorveglianza degli appalti a un commissario governativo individuato proprio nel presidente dell'ANAC.[8]
Per iniziativa di Cantone viene così inaugurato in via sperimentale l'istituto della “vigilanza collaborativa”, ovvero la verifica preliminare di legittimità delle procedure di gara da parte dell'ANAC, con l'obiettivo di evitare il contenzioso amministrativo e ridurre i rischi di corruzione. Riconosciuta best practice internazionale dall'OCSE, che vi ha dedicato una pubblicazione monografica[9], il nuovo Codice degli appalti[10] ha istituzionalizzato la “vigilanza collaborativa” dell'Autorità anticorruzione, che per contratti di particolare rilievo può essere richiesta dalle stazioni appaltanti previa stipula di un apposito protocollo di intesa.
Nel 2016 è stato nominato dal Ministro della Giustizia coordinatore del Tavolo tecnico “Mafie, corruzione e pubbliche amministrazioni” nell'ambito degli Stati generali della lotta alle mafie.[11]
Partecipa ai lavori della Consulta internazionale sulla giustizia, la corruzione, il crimine organizzato e le mafie[12], istituita presso il Dicastero per il Servizio dello Sviluppo Umano Integrale dello Stato del Vaticano.
A luglio 2019, in una lettera aperta pubblicata sul sito dell'Autorità nazionale anticorruzione, ha annunciato l'intenzione di rientrare in magistratura "per il manifestarsi di un diverso approccio culturale nei confronti dell'Anac e del suo ruolo".[14]
È autore di numerosi articoli pubblicati sul quotidiano Il Mattino e di numerose pubblicazioni in materia giuridica. Collabora con riviste giuridiche, quali Cassazione Penale, Rivista Penale, Archivio nuova procedura penale e Gazzetta Forense.
Nel 2008 ha pubblicato per la Mondadori, Solo per giustizia, opera autobiografica in cui ripercorre la sua esperienza di magistrato di prima linea.
Del 2010 è Gattopardi, per la collana Strade blu (Mondadori Editore), come per il precedente scritto diventato in pochi mesi best seller.
Nell'aprile del 2012, per la Collana "Frecce" di Mondadori editore, esce Operazione Penelope; un libro dove Cantone affronta il tema mafie analizzando una risposta a un interrogativo, contenuto nel sottotitolo al testo: "Perché la lotta alla criminalità organizzata e al malaffare rischia di non finire mai". Una tela, quella che nel poema omerico, Penelope realizza e disfa nell'attesa del suo Ulisse, che, sebbene dopo lungo tempo, riuscirà a tornare a Itaca. Eccola, la metafora solo apparentemente pessimista, che Raffaele Cantone prende a modello, analizzando le dinamiche che ruotano intorno alle mafie e alle possibilità di riuscire nell'opera di contrasto a esse.
Con Football Clan, pubblicato con Rizzoli, Raffaele Cantone e Gianluca Di Feo ricostruiscono i rapporti tra mafia e pallone. Ma non è solo un garbato atto d'accusa a un sistema così indulgente con se stesso da chiudere sempre gli occhi davanti a contaminazioni sempre più evidenti. È anche una sorta di breviario, la storia di un fenomeno da non sottovalutare ricostruita con il gusto dell'aneddoto (Marco Imarisio, per il Corriere della Sera).
Del 2017 è La corruzione spuzza, scritto assieme al consigliere di Stato Francesco Caringella. Riprendendo una frase pronunciata da Papa Francesco a Scampia, il libro passa in rassegna, come recita il sottotitolo, “tutti gli effetti sulla nostra vita quotidiana della malattia che rischia di uccidere l'Italia”, dalla sanità all’istruzione, dalla politica agli appalti pubblici. Seguito “ideale” del volume è La corruzione spiegata ai ragazzi che hanno a cuore il futuro del loro Paese (2018), nato dal suggerimento, rivolto da numerosi studenti e docenti nel corso della presentazione nelle scuole del precedente libro, di realizzare un testo che fosse pensato appositamente per i più giovani.
Del 2023 è il libro Corruzione: prevenire e reprimere per una cultura della legalità, scritto per la collana "Piccola biblioteca per un paese normale" della casa editrice Vita e Pensiero; un saggio che offre un quadro completo del fenomeno (definizione, modalità di manifestazione della corruzione, come misurarla, contrastarla e prevenirla), corredato da riferimenti storici, analisi antropologiche e prospettive per il futuro.
Attività accademica
È stato professore a contratto per la cattedra di diritto penale presso l’Università Federico II di Napoli nell’anno accademico 2003/2004 e per cinque anni, fino al 2009-2010, professore a contratto di diritto penale amministrativo presso l’Università telematica Guglielmo Marconi di Roma.
Nominato nel 2013 docente della Scuola di polizia tributaria per i corsi agli ufficiali e sottufficiali della Guardia di finanza in materia di “legislazione antimafia”, svolge attività didattica presso la Scuola nazionale dell’amministrazione, la Scuola Superiore di Polizia, la Scuola Superiore della Presidenza del Consiglio dei Ministri, l’Istituto tecnico investigativo dell’Arma dei Carabinieri e l’Istituto Alti Studi della Difesa.
Nell’anno accademico 2016/2017 ha tenuto l’insegnamento di “Responsabilità amministrativa e legislazione anticorruzione” presso l’Università di Cassino.
È attualmente professore a contratto - a titolo gratuito - dell’insegnamento di “Legislazione antimafia: profili sostanziali e processuali” presso l’Università Suor Orsola Benincasa di Napoli e dell’insegnamento “Prevenzione della Corruzione e Trasparenza nella Pubblica amministrazione” presso il Dipartimento di Giurisprudenza dell’Università Federico II, sempre a Napoli.
Il farmacista Mascolo, in La ferita. Racconti per le vittime innocenti di camorra, Napoli, Ad est dell'equatore, 2009, ISBN 978-88-95797-10-6.
I gattopardi: uomini d'onore e colletti bianchi: la metamorfosi delle mafie nell'Italia di oggi, Milano, Mondadori, 2010, ISBN 978-88-04-60327-6.
Operazione Penelope: perché la lotta alla criminalità organizzata e al malaffare rischia di non finire mai, Milano, Mondadori, 2010, ISBN 978-88-04-62138-6.
Football clan: perché il calcio è diventato lo sport più amato dalle mafie, con Gianluca Di Feo, Milano, Rizzoli, 2012, ISBN 978-88-17-05900-8.
Il collega che avrei voluto conoscere, in Dove Eravamo. Vent'anni dopo Capaci e via D'Amelio, Napoli, Caracò Editore, 2012, ISBN 978-88-97567-08-0.
Il male italiano. Liberarsi dalla corruzione per cambiare il paese, con Gianluca Di Feo, Milano, Rizzoli, 2015, ISBN 978-88-17-07426-1.
La corruzione spuzza. Tutti gli effetti sulla nostra vita quotidiana della malattia che rischia di uccidere l'Italia, con Francesco Caringella, Milano, Mondadori, 2017, ISBN 9788804673002.
La corruzione spiegata ai ragazzi che hanno a cuore il futuro del loro paese, con Francesco Caringella, Milano, Mondadori, 2018. ISBN 8804686065; ISBN 9788804686064
Corruzione e anticorruzione. Dieci lezioni, con Enrico Carloni, Feltrinelli, 2018. EAN 9788807173448
La coscienza e la legge. Con Vincenzo Paglia, Laterza, 2019. EAN: 9788858135228
Corruzione: prevenire e reprimere per una cultura della legalità, Vita e Pensiero, Milano 2023. EAN 9788834343524
Monografie
7: I delitti contro l'amministrazione della giustizia e i delitti contro il sentimento religioso e la pietà dei defunti, curatela con Maria Grazia Rosa e Carmelo Sgroi, Milano, Giuffrè, 2000, ISBN 88-14-08232-4.
Il giusto processo: commento organico alla L. 1 marzo 2001, n.63, Napoli, Edizioni Giuridiche Simone, 2001, ISBN 88-244-9816-7.
I reati fallimentari, Napoli, Edizioni Giuridiche Simone, 2001, ISBN 88-244-9643-1.
La nuova Autorità nazionale anticorruzione, curatèla con Francesco Merloni, Torino, Giappichelli, 2015, ISBN 978-88-7524-231-2.
Codice dell'anticorruzione e della trasparenza, Maggioli, 2018 (con Francesco Merloni) ISBN 978-88-916-3023-0.
Prefazioni
Raffaele Cantone, Associazione per delinquere di stampo mafioso; Voto di scambio; Postfazione, Roma, Castelvecchi Rx in Dizionario enciclopedico delle mafie in Italia, 2013, ISBN978-88-7615-864-3.
Baldieri-Franzinelli, Il volto di Gomorra, Milano, Mondadori, 2011, ISBN978-88-370-8459-2.
AA VV, Carta straccia. Economia dei diritti sospesi, Napoli, Ad est dell'equatore, 2011, ISBN978-88-95797-23-6.
Corrado De Rosa, I medici della camorra, Roma, Castelvecchi editore, 2011, ISBN978-88-7615-525-3.
AA VV, La ferita. Racconti per le vittime innocenti di camorra, Napoli, Ad est dell'Equatore, 2009, ISBN978-88-95797-10-6.