Dopo aver frequentato il seminario diocesano di Ascoli Satriano, ha compiuto gli studi del ciclo istituzionale presso il seminario regionale di Benevento, conseguendovi il baccalaureato in teologia nel 1972.
Dopo l'ordinazione sacerdotale, dal 1972 al 1977 è stato vicerettore del seminario di Foggia ed assistente dell'Azione Cattolica Ragazzi. Ha proseguito gli studi presso l'Università degli Studi di Bari conseguendo, nel 1974, la laurea in filosofia con una tesi intitolata L'antropologia di Bonhoeffer come premessa al suo impegno politico.
Dal 1974 al 1977 è stato anche docente al Pontificio Seminario Regionale di Benevento, mentre nel 1975 ha ottenuto l'abilitazione all'insegnamento di filosofia e scienze umane per scuole medie superiori dello Stato, insegnandovi dal 1978 al 1985 storia e storia della filosofia.
Dal 1978 al 1979 è stato professore inviato della Pontificia facoltà teologica dell'Italia meridionale di Napoli; nel 1981 ha conseguito il dottorato di ricerca in teologia dogmatica presso la stessa facoltà, nella Sezione San Luigi, divenendo lo stesso anno professore incaricato, incarico svolto fino al 1982. Ha ottenuto, quindi, nel 1985, il dottorato in teologia con una tesi intitolata La storicità come fedeltà alla terra in Dietrich Bonhoeffer. È divenuto poi professore aggiunto (1988–1989), associato (1991–1992), straordinario (1995–1996) e infine ordinario dal 2002 fino al 2012 quando è divenuto professore emerito.
Il 23 gennaio 2013 si è recato, assieme agli altri membri dell'episcopato calabrese, in visita ad limina apostolorum in Vaticano, discutendo con il pontefice della situazione e dei problemi relativi alla sua diocesi[4].
Il 25 marzo 2014 è stato nominato segretario generale della Conferenza Episcopale Italianaad quinquennium[7], perciò il 28 febbraio 2015 ha rinunciato alla guida pastorale della diocesi di Cassano all'Jonio per dedicarsi interamente al suo nuovo incarico, divenendone vescovo emerito[8]; gli è succeduto Francesco Savino, del clero di Bari-Bitonto.
Il 15 marzo 2018 ha rilasciato un'intervista a Famiglia Cristiana sul rapporto tra mafia e Massoneria nella quale dichiarava che «tutto ciò che da singoli o gruppi attenta al Bene comune a vantaggio di pochi non può essere accettato»[9]. Pur non avendo criticato il papa per il mancato ripristino della scomunicalatae sententiae per i cattolici – e specialmente per gli ecclesiastici – che aderivano alla Massoneria, l'intervista ha suscitato una dura replica da parte di Stefano Bisi[10].
Il 2 ottobre 2023 è cessato dall'incarico di presidente dell'Amministrazione del patrimonio della Sede Apostolica, per raggiunti limiti di età[14], e il 15 novembre seguente ha lasciato anche l'incarico di presidente della Fondazione per la sanità cattolica; gli è succeduto in entrambi gli incarichi il presbiterosalesianoGiordano Piccinotti, fino ad allora sottosegretario dell'Amministrazione del patrimonio della Sede Apostolica.
Partito: nel 1º d'azzurro, all'aquila proveniente dall'ambone medievale della chiesa madre di Cerignola, posata in maestà su di una colonnina con capitello in figura di testa umana, e reggente un leggio, il tutto di marmo al naturale e cimato da un libro aperto, caricato delle lettere Alfa e Omega di rosso; nel 2º d'oro, al destrocherio di carnagione vestito di bianco, uscente dal fianco sinistro dello scudo, ed impugnante un giglio di giardino al naturale. Lo scudo accollato a una croce astile trifogliata d'oro, gemmata di quattro pezzi d'azzurro, e timbrato da un cappello prelatizio a sei nappe per lato, il tutto di verde.
Nunzio Galantino, Grazia Calandriello, Validità di una psicoterapia del significato, Ercolano (Benevento), Poligrafico campano, [1977?]
Nunzio Galantino, Storicità come fedeltà alla terra in Dietrich Bonhoeffer. Estratto dalla tesi di laurea in teologia settore dogmatico, Napoli, Morcelliana, 1985
Il Concilio venti anni dopo, vol. 3: Il rapporto Chiesa-mondo, a cura di Nunzio Galantino, Roma, A.V.E., 1986
Nunzio Galantino, Antropologia contemporanea in prospettiva catechetica, Napoli, D'Auria, [1986?]
Nunzio Galantino, Coscienza storica, interpretazione e verità, Roma, A.V.E., 1988
Augusto Cavadi, Nunzio Galantino, Enrico Guarneri, Alla ricerca dell'uomo: lineamenti di antropologia filosofica, Palermo, Augustinus, 1988
Nunzio Galantino, Aniceto Molinaro, Pier Paolo Portinaro, L'agire responsabile. Lineamenti di etica filosofica, Palermo, Augustinus, 1991; 1992 I rist.
Nunzio Galantino, Dire "uomo" oggi. Le nuove vie dell'antropologia filosofica, Cinisello Balsamo, Edizioni Paoline, 1993
Metodologia teologica. Avviamento allo studio e alla ricerca pluridisciplinari, a cura di Giuseppe Lorizio e Nunzio Galantino, Cinisello Balsamo, San Paolo, 1992; 1997 II ed.; 2004 III ed. completam. riv. e aggiornata ("Universo teologia" 28)
Antonio Rosmini, Delle cinque piaghe della Santa Chiesa, testo ricostruito nella forma ultima voluta dall'autore, con saggio introduttivo e note di Nunzio Galantino, Cinisello Balsamo, San Paolo, 1997
Nunzio Galantino, Giuseppe Lorizio, Sapere l'uomo e la storia. Interpretazioni rosminiane, Cinisello Balsamo, San Paolo, 1998
Nunzio Galantino, Antonio Trupiano, Dietrich Bonhoeffer. Storia profana e crisi della modernità, Cinisello Balsamo, San Paolo, 2000
Nunzio Galantino, Sulla via della persona. Percorsi di Antropologia filosofica, Napoli, Tipolitografia Laurenziana, 2001
Nunzio Galantino, Il riformismo rosminiano e la sua condanna. Istanze reali e letture strumentali, in Rosmini e Gioberti pensatori europei, a cura di G. Beschin e L. Cristellon, Brescia, Morcelliana, 2003, pp. 325–342
Nunzio Galantino, Tra adulti "narcisisti" e giovani "senza progetto", in Di generazione in generazione. La difficile costruzione del futuro. V Forum del progetto culturale, Bologna, EDB, [2004], pp. 271–274
Nunzio Galantino, Sulla via della persona. La riflessione sull'uomo: storia, epistemologia, figure e percorsi, Cinisello Balsamo, San Paolo, 2006
Antonio Rosmini, Le cinque piaghe della Santa Chiesa, apparati e note di Nunzio Galantino, Milano, San Paolo, 2007
Antonio Trupiano, La via della sapienza in Josef Pieper e Dietrich Bonhoeffer. Interpretazione della realtà e discernimento del bene, presentazione di Donatella Abignente, postfazione di Nunzio Galantino, Assisi, Cittadella, 2010
Nunzio Galantino, Pensare la persona per servire la persona, in La persona nella città. Per un nuovo progetto di convivenza, a cura di Giulio Parnofiello S.l., Trapani, Il pozzo di Giacobbe, 2010, pp. 77–86
Sull'anima. È in gioco l'uomo e la sua libertà, a cura di Nunzio Galantino, Assisi, Cittadella, 2011
Angelo Giuseppe Dibisceglia, Nunzio Galantino, La Chiesa Madre di Cerignola. Storia e documenti nella vita e per la vita di una comunità credente, Foggia, Grenzi, 2011
Nunzio Galantino, Abitare le parole. Alla ricerca della consapevolezza di sé, Bologna, EDB, [2012]