La Coppa d'Estonia 2013-2014 (in estoneEesti Karikas) è stata la 22ª edizione del torneo. La competizione è iniziata il 28 maggio 2013 ed è terminata il 17 maggio 2014. Il Levadia Tallinn ha vinto il trofeo per l'ottava volta nella sua storia.
15 al primo turno: Ajax Lasnamäe, Dünamo Rummu, Ganvix Türi, Infonet II, Joker Raasiku, Kaitseliit/Kalev, Loo, Maardu, Metropool Pärnu, Noorus-96 Jõgeva, Nõmme United, Santos Tartu, Saue Laagri, Tartu SK 10 II, Ülikool Tallinn.
1 al secondo turno: Welco Elekter Tartu.
29 squadre di III Liiga 2013
24 al primo turno: Ambla, Atli Rapla, Eestimaa Kasakad, EMÜ, Eston Villa, FC Lelle, Kaitseliit/Kalev II, Kalev Tallinn III, Kernu Kadakas, Kose, Leisi, Lihula, Lootos Põlva, Maccabi Tallinn, Navi, Olympic Tallinn, Otepää, Piraaja Tallinn, Rada Kuusalu, Retro, Tõrva, Trummi, Võru, Warrior Valga.
5 al secondo turno: Balteco, Järva-Jaani, Saaremaa, Tääksi, Viimsi MRJK.
23 squadre di IV Liiga 2013
20 al primo turno: Dnipro Tallinn, Harrastajad Tartu, Igiliikur Viimsi, Imavere Forss, Kalev Tallinn Juunior, Kalju Nõmme III, Kiiu, Merkuur Tartu, Pärnu-Jaagupi, Pirita Reliikvia, Pokkeriprod, Reaal Tallinn, Revali Pühajärve, Saku Sporting, Soccernet, Suema/Cargobus, Taebla, Tapa, Twister, Ülikool Fauna Tartu.
3 al secondo turno: Haiba, IAFA Estonia, Toompea.
16 squadre di Rahvaliiga 2013
11 al primo turno: Donkers, Eesti Väitlusselts, Helios Tartu, Kose, Nirvaana, Õismäe Torm, Raudteetöölised, Roosad Pantrid, Shnelli, Tehased Tartu, Wiswald Rakvere.
5 al secondo turno: Jalgpallihaigla, Kohtla-Nõmme, Smuuli, Tartu FC, Väätsa Vald.