Il commence aussitôt à travailler comme employé de la National Bank de Washington DC, occupant cet emploi jusqu'en 1986, lorsqu'il rentre aux Pays-Bas pour occuper, pendant un an, un poste de conseiller politique au ministère des Finances. En 1988, il est recruté par le groupe parlementaire du VVD comme conseiller en politique économique et monétaire, renonçant à ce poste pour se lancer dans la vie politique en 1994.
Vie privée
Il est père d'un enfant et s'est marié à Mexico le .
Le , il est nommé secrétaire d'État à la Sécurité sociale et aux Conditions de travail, au sein du ministère des Affaires sociales et de l'Emploi, dans la deuxième coalition violette dirigée par le social-démocrate Wim Kok. Lorsque celui-ci démissionne avec l'ensemble de son gouvernement le , les ministres et secrétaires d'État sont chargés de l'intérim de leurs fonctions.
Ministre des Finances
Un nouveau gouvernement, soutenu par les chrétiens-démocrates, les libéraux et les populistes, est finalement formé sous la direction de Jan Peter Balkenende le , et Hans Hoogervorst devient ministre des Finances. L'alliance s'écroule dès le 16 octobre, victime des luttes internes au parti populiste, et il se voit chargé de l'intérim de son département ministériel et du ministère des Affaires économiques.
Ministre de la Santé
Réélu aux élections législatives anticipées du 22 janvier 2003, il continue d'exercer l'intérim jusqu'à la formation d'une nouvelle coalition le 27 mai, dans laquelle il exerce les fonctions de ministre de la Santé, du Bien-être et des Sports. Le , les Démocrates 66 (D'66) se retirent du cabinet, et une nouvelle équipe minoritaire prend le relais le 7 juillet en attendant la tenue d'élections anticipées le 22 novembre. À cette occasion, il est choisi comme directeur de campagne du VVD par son nouveau chef politique, Mark Rutte, mais sa stratégie échoue puisque le parti recule de six sièges et trois points, abandonnant au Parti socialiste (SP) la place de troisième force politique.
Il reste ministre de la Santé par intérim jusqu'au , puis quitte la vie politique.