Agrégée de philosophie (1957), Claire Salomon-Bayet soutient en 1976 un doctorat ès-lettres (philosophie et histoire des sciences) sous la direction de Georges Canguilhem. De 1957 à 1959, elle est professeure de lettres supérieures au lycée Louis-Pasteur de Besançon. Puis, de 1960 à 1964, elle est secrétaire de rédaction de la Revue de l’enseignement supérieur et des études philosophiques. Peu après, elle est assistante à la Sorbonne (1964-1968), avant d'intégrer le CNRS où elle reste jusqu'en 1981, membre de l’Institut d’histoire des sciences[2].
De 1981 à 1988, elle est élue professeure de philosophie à l’université Lille-III, où elle croise Bertrand Saint-Sernin, Gérard Simon et Jean Bollack. En parallèle, de 1986 à 1990, elle est également directrice scientifique adjointe du Département des « Sciences de l’homme et de la société » du CNRS, dont Jacques Lautman est le directeur[2].
En 1990, Claire Salomon-Bayet est nommée à la chaire d’histoire des sciences de l’UFR d’histoire de l’Université de Paris I, succédant à Jacques Roger. De 1988 à 1998, elle dirige le Centre d’histoire des sciences et des mouvements intellectuels[2].
2004. « Variations sur le temps », in Bulletin de la Société française de philosophie, Paris : Vrin.
2003. « Été 1953. La Messuguière, rencontres et liberté », in Cabris et culture, 4e entretiens de Cabris.
1995. « L’histoire des sciences et des techniques », p. 279-292, in François Bédarida (dir.), L’Histoire et le métier d’historien en France, 1945-1995. Paris : Éditions de la Maison des Sciences de l’Homme, 438 p.
1995. « Introduction », p. 7-30, in F. Balibar et M.L. Prévot (dir.), Pasteur. Cahiers d’un savant. Paris : Zulma, coll. « Manuscrits », 254 p.
1986 (dir.). Pasteur et la révolution pastorienne. Paris : Payot, coll. « Médecine et sociétés », 436 p. (ISBN978-2-228-55080-2)
1986 (en coll.). Sur la dissymétrie moléculaire, Louis Pasteur, A. Werner, J. H. Vant’Hoff. Paris : Bourgois, 280 p.
1984. « La science moderne et la coexistence des rationalités ». Diogène, nº 126, p. 3-21. Paru en anglais sous le titre « Modern Science and the Coexistence of Rationalities », in Diogenes, nº 126 (été), p. 1-19.
1982. « Bacteriology and Nobel Prize Selection, 1901-1920 » in G. Bernhard, E. Crawford et P. Sörbom (dir.), Science, Technology and Society in the Time of Alfred Nobel, Londres : Pergamon Press.
1979. Édition scientifique de Cournot, Matérialisme, vitalisme, rationalisme. Étude sur l’emploi des données de la science en philosophie. Paris : Vrin & CNRS, 272 p. Réédition en 1987.
1978. L'Institution de la science et l'expérience du vivant. Méthode et expérience à l'Académie royale des sciences. 1666-1793. Paris : Flammarion, coll. « Champs Sciences ». (ISBN978-2-08-121163-6) (réédition: 1991, 2008)
1968. Jean-Jacques Rousseau ou l'impossible unité. Paris : Seghers, coll. « Philosophies de tous les temps », 183 p. Réédition en 1971.
Textes en ligne
Haut comité des Célébrations nationales (dir.) (préf. Salomon-Bayet, Claire), Célébrations nationales, Paris, Ministère de la culture et de la communication, (lire en ligne)
Salomon-Bayet, Claire, « Le néo-hippocratisme aurait-il un avenir ? », Histoire des sciences médicales, vol. 37, no 33, , p. 349-355 (lire en ligne)
Salomon-Bayet, Claire, « Les Lumières. Suite ou fin? », dans Les origines de la création, Paris, UNESCO, , 134 p. (lire en ligne), p. 81-88
Salomon-Bayet, Claire, « Georges Canguilhem en son temps. Présentation / Introduction », Revue d'histoire des sciences, vol. 53, no 1, , p. 5-8 (lire en ligne)
Salomon-Bayet, Claire, « Découvertes scientifiques. Transmission et réception des savoirs. Introduction », dans Actes du XIXe Congrès international des Sciences historiques, Oslo, Comité international des sciences historiques, (lire en ligne)
Salomon-Bayet, Claire, « La gloire de Pasteur », Romantisme, no 100, , p. 159-169 (lire en ligne)
Salomon-Bayet, Claire, « Jean-Baptiste Dumas », dans Célébrations nationales, Paris, ministère de la Culture et de la Communication, (lire en ligne)
Salomon-Bayet, Claire, « L'institution de la science : un exemple au XVIIIe siècle », Annales (Économies, sociétés, civilisations), vol. 30, no 5, , p. 1028-1044 (lire en ligne)
Salomon-Bayet, Claire, « Opiologia, imposture et célébration de l'opium », Revue d'histoire des sciences, vol. 25, no 2, , p. 125-150 (lire en ligne)
Salomon-Bayet, Claire, « Un préambule théorique à une Académie des Arts. Académie royale des Sciences (1693-1696). Présentation et textes », Revue d'histoire des sciences et de leurs applications, vol. 23, no 3, , p. 229-250 (lire en ligne)