San Andrés del Rey liegt in einer Höhe von ca. 1020 m in der Kulturlandschaft der Alcarria. Die Entfernung zur westlich gelegenen Provinzhauptstadt Guadalajara beträgt etwa 32 Kilometer (Fahrtstrecke).
Das Klima ist gemäßigt bis warm; Regen (569 mm/Jahr) fällt übers Jahr verteilt.[2]