Seit 2013 engagierte sich Günther-Wünsch für den CDU-Kreisverband Wuhletal in der Berliner Kommunalpolitik. Seit 2016 ist sie stellvertretende Vorsitzende des CDU-Ortsverbandes Kaulsdorf-Mahlsdorf und Mitglied der Bezirksverordnetenversammlung (BVV) von Marzahn-Hellersdorf. Sie war stellvertretende Fraktionsvorsitzende der CDU-Fraktion der BVV und Mitglied der Ausschüsse für Schule, Jugendhilfe sowie Gleichstellung.[3]
2021 nominierte der Kreisverband der CDU Wuhletal anlässlich der Abgeordnetenhauswahl 2021 Günther-Wünsch für ein Direktmandat im Wahlkreis Marzahn-Hellersdorf 5 sowie für den Platz 3 der Bezirksliste.[4] Bei der Wahl gewann sie das Direktmandat mit 33,7 Prozent und zog in das Abgeordnetenhaus von Berlin ein. Dort ist Günther-Wünsch Mitglied der Ausschüsse für Bildung, Jugend und Familie[5], Umwelt, Verbraucher- und Klimaschutz[6] sowie Sport.[7] Sie war Beisitzerin im Präsidium des Berliner Abgeordnetenhauses[8] und bildungspolitische Sprecherin[9] der CDU-Fraktion im Abgeordnetenhaus.[10] Bei der Wiederholungswahl 2023 konnte sie ihren Sitz im Abgeordnetenhaus verteidigen.[11]
↑Eine Lehrerin soll Schulsenatorin werden: Das sind die Pläne der Berliner CDU für die Bildungspolitik. In: Der Tagesspiegel Online. ISSN1865-2263 (tagesspiegel.de [abgerufen am 5. April 2023]).
↑Berlins Bildungssenatorin Katharina Günther-Wünsch: Zu kompetent, um dem Kalkül geopfert zu werden. In: Der Tagesspiegel Online. ISSN1865-2263 (tagesspiegel.de [abgerufen am 9. Januar 2024]).
↑„Privates und Berufliches strikt trennen“ : Berlins Regierungschef Wegner und Senatorin bestätigen ihre Beziehung. In: Der Tagesspiegel Online. ISSN1865-2263 (tagesspiegel.de [abgerufen am 5. Januar 2024]).