Nach dem Rücktritt des Abgeordneten David C. Treen, der zum Gouverneur von Louisiana gewählt worden war, wurde Tauzin bei der fälligen Nachwahl für den dritten Sitz von Louisiana als dessen Nachfolger in das US-Repräsentantenhaus in Washington, D.C. gewählt. Dort trat er am 22. Mai 1980 sein neues Mandat an. Nach acht Wiederwahlen konnte er bis zum 3. Januar 2005 im Kongress verbleiben. Tauzin galt als einer der konservativsten demokratischen Abgeordneten. Im Jahr 1995 erschien ihm seine Partei als zu liberal; daher wechselte er zur Republikanischen Partei, als deren Kandidat er bei den folgenden Wahlen bis einschließlich 2002 in das US-Repräsentantenhaus gewählt wurde. Zwischen 2001 und 2004 gehörte er als Vorsitzender dem Energie- und Handelsausschuss an. Im Jahr 2004 verzichtete Tauzin aus gesundheitlichen Gründen auf eine erneute Kandidatur.
Nach seiner Zeit im US-Repräsentantenhaus wurde Billy Tauzin Präsident und Vorstandsvorsitzender einer pharmazeutischen Lobbyfirma. Er ist in zweiter Ehe verheiratet, aus seiner ersten Ehe hat er fünf erwachsene Kinder.