Do soutěže mužské čtyřhry na tenisovém turnaji Mutua Madrid Open 2016 nastoupilo dvacet čtyři dvojic. Obhájcem titulu byl indicko-rumunská pár Rohan Bopanna a Florin Mergea.
Vítězem čtyřhry se stal třetí nasazený nizozemsko-rumunský pár Jean-Julien Rojer a Horia Tecău, který ve finále zdolal turnajové šestky Bopannu s Mergeou výsledkem 6–4 a 7-6. Na podání ztratili pouze jediný míč, když 39 výměn ze 40 vyhráli. Oba šampioni si do žebříčku ATP připsali 1000 bodů a v premiérovém finále sezóny získali své první trofeje z kategorie ATP Masters. Tecău si odvezl dvacátý debátý deblový titul z okruhu ATP Tour a pro Rojera to byla dvacátá první trofej ze čtyřhry.[1]
Všech osm nasazených párů mělo volný los do druhého kola.
V tomto článku byl použit překlad textu z článku 2016 Mutua Madrid Open – Men's Doubles na anglické Wikipedii.