化石是一個部分頭顱骨與下頜、不完整的身體骨骼,發現於中國遼寧省的髫髻山組。在2010年,呂君昌、富察曉蕙將這個化石正式敘述、命名。模式種是玲瓏塔古帆翼龍(A. linglongtaensis),屬名意為「古老的帆翼龍」,種名則是以化石發現處的玲瓏塔鎮為名。呂君昌等人將古帆翼龍歸類於Breviquartossa演化支,並認為牠們的最近親是帆翼龍科。呂君昌等人認為古帆翼龍比白堊紀的帆翼龍科還要原始,因此古帆翼龍可能是帆翼龍科的直系祖先,而不屬於帆翼龍科[1]。在2012年,大衛·馬提爾(David M. Martill)、Steve Etches等人提出古帆翼龍的正模標本,可能是達爾文翼龍的一個保存較差化石[2]。