五稜郭站(日语:五稜郭駅/ごりょうかくえき Goryōkaku eki */?)位於北海道函館市龜田本町64,是北海道旅客鐵道(JR北海道)與道南漁火鐵道的鐵路車站,管理權歸北海道旅客鐵道。而車站範圍內同時設有由日本貨物鐵道(JR貨物)管理的函館貨運站。
島式月台2面4線的地面車站。月台編號是以最靠近車站大樓的月台起計算,依序為3、4、5、6號月台。
函館市交通局函館市電車於1955年(昭和30年)11月27日延長本線時(鐵道工場前-五稜郭站前)所新設此車站。在1978年(昭和53年)11月1日廢除部份本線時(瓦斯會社前-五稜郭站前)被廢除。
車站屬於2面1線模式。並於2005年(平成17年)因為國道5號的擴建工程而被拆除。