Менделеевская линия. Бульвар и здание философского и исторического факультетов Санкт-петербургского государственного университета, построенное как Новобиржевой Гостиный двор
Менделеевская линия расположена в восточной части Васильевского острова, который после основания Санкт-Петербурга был подарен Петром I князю Александру Даниловичу Меншикову. В 1710 году было начато строительство первого каменного здания в городе — дворца А. Д. Меншикова. Когда на острове было решено строить административный центр Санкт-Петербурга, остров перешёл в ведение казны. Восточный мыс (Стрелка Васильевского острова) должен был стать главной городской площадью. Западную (дальнюю от берега) сторону этой площади начали застраивать уже в 1720-х годах. С 1722 по 1736 год по проекту архитектора Доменико Трезини строилось здание Двенадцати коллегий, которое образовало чётную сторону современной Менделеевской линии.
Вдоль улицы в начале XVIII века был прокопан канал, который помогал осушить территорию Коллежской площади, находящейся с восточной (нечётной) стороны улицы. Саму линию с 1776 года тоже называли Коллежской. Канал был закопан в конце XVIII века. В 1783—1789 годах на будущей Университетской набережной торцом к Коллежской линии по проекту архитектора Джакомо Кваренги было построено здание Академии наук. По его же проекту в 1800—1815 годах был построен Новобиржевой Гостиный двор.
В 1820-х годах к востоку от улицы появился Биржевой сквер, в 1826—1831 годах по проекту архитектора И. Ф. Лукини был построен музейный флигель Академии наук. В 1834 году был разбит сквер вдоль всего здания Двенадцати коллегий.
Улицу иногда включали в состав Биржевой линии, но в 1849 году окончательно отделили от неё и назвали Университетской линией. На месте Коллежской площади в 1899—1904 годах было построено здание Императорского клинического повивально-гинекологического института (современный НИИ акушерства и гинекологии им. Д. О. Отта) по проекту архитектора Л. Н. Бенуа. Это здание окончательно сформировало застройку улицы.
С января 1866 года по август 1890 года в нижнем этаже здания Двенадцати коллегий жил и работал выдающийся учёный Д. И. Менделеев. В память о нём 6 октября 1923 года Университетскую линию переименовали в линию имени Профессора Менделеева. В быту быстро сформировалось более короткое название Менделеевская линия, так она стала называться с 1930-х годов.
В 1936 году в центре линии был разбит сквер, перепланированный в 1950-х годах архитектором Б. М. Серебровским. В 1986 году на пересечении Менделеевской линии с Университетской набережной был установлен памятник М. В. Ломоносову.
Горбачевич К. С., Хабло Е. П. Почему так названы?: О происхождении названий улиц, площадей, островов, рек и мостов Ленинграда. — 3-е изд., испр. и доп. — Л.: Лениздат, 1985. — С. 236. — 511 с.
Менделеевская линия // Городские имена сегодня и вчера: Петербургская топонимика / сост. С. В. Алексеева, А. Г. Владимирович, А. Д. Ерофеев и др. — 2-е изд., перераб. и доп. — СПб.: Лик, 1997. — С. 76—77. — 288 с. — (Три века Северной Пальмиры). — ISBN 5-86038-023-2.
Зодчие Санкт-Петербурга. XIX — начало XX века / сост. В. Г. Исаченко; ред. Ю. Артемьева, С. Прохватилова. — СПб.: Лениздат, 1998. — 1070 с. — ISBN 5-289-01586-8.
Горбачевич К. С., Хабло Е. П. Почему так названы?: О происхождении названий улиц, площадей, островов, рек и мостов Санкт-Петербурга. — 5-е изд., перераб. — СПб.: Норинт, 2002. — 353 с. — ISBN 5-7711-0019-6.