Nota: Se procura Fernão de Magalhães, por vezes também designado Fernando Magalhães, navegador português dos séculos XV e XVI, veja Fernão de Magalhães.
Filho de Antônio Joaquim Ribeiro de Magalhães e de Deolinda de Magalhães. Formou-se pela Faculdade de Medicina da Universidade do Rio de Janeiro (1899). Nos dizeres do professor Jorge de Resende (1998), discípulo de Fernando Magalhães, "A Obstetrícia no Brasil será dividida, pelo historiador do futuro, em dois períodos: antes e depois de Fernando Magalhães".
É considerado por alguns como o criador da Escola Obstétrica Brasileira. Depois de sua morte, Fernando Magalhães deu nome a várias instituições, médicas ou não.
Deixou uma vasta obra médica, da qual se destacam os seis volumes de Clínica obstétrica, as Lições de clínica obstétrica, A obstetrícia no Brasil, Síntese obstétrica e Obstétrica forense, e mais de 200 trabalhos esparsos sobre assuntos médicos.
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