Издавачката дејност во Епархијата е прилично развиена. Се јавуваат бројни црковно-канонски публикации. Брегалничката епархија го издава списанието „Троичник“, кој излегува од печат трипати годишно.
Митрополити
Име
Години на управување
Митрополит Брегалнички г. Стефан
12 јули 1986 - 9 октовмри 1999
Митрополит Брегалнички г. Агатангел
26 ноември 2000 – 7 октомври 2006
Митрополит Брегалнички г. Иларион
22 август 2006 - денес
Административна поделба
Брегалничката епархија е поделена на четири архијерејски намесништва, кои и тие се состојат од повеќе парохии:[1]