1974년8월 15일1호선이 개통하였을 당시에는 1호선에 이 역이 없었다. 하지만 2기 지하철 계획이 세워지고 동묘 부근에 6호선 동묘앞역이 건설되면서 1호선과의 환승 문제가 거론되었다.
당초 계획은 6호선 동묘앞역과 1호선, 4호선동대문역 간의 환승 통로를 연결하여 환승시키려는 것이었으나, 이 안은 환승 통로가 약 300m에 달하여 지나치게 길다는 이유로 백지화되었다. 그 대신 6호선 개통 직전인 2000년에 1호선 상에 역을 새로 만들어 6호선과 연계시키기로 결정하였다. 1호선 역사는 2005년12월 21일에 완공되어 영업을 시작하였다.
출구 및 주변 정보
출구는 10개가 있다. 1~3, 10번 출구는 1호선, 4~9번 출구는 6호선의 출구이다. 최초에는 6호선 역의 출구만으로 1번부터 6번까지의 번호가 부여되어 있었고, 그 중 3~4번이 완공되지 않은 채로 번호를 비워놓고 영업을 개시하였으나, 2005년 12월 21일 1호선 역의 개업에 따라 출구 번호가 전면 개정되어 원래의 1~2, 5~6번 출구가 6~7, 4~5번 출구로 각각 번호가 바뀌었고 완공되지 않았던 3~4번은 각각 8~9번 출구로써 완공되기에 이르렀다. 아울러 1호선 역에는 4개의 출구가 새로 만들어져 1~3, 10번 출구가 되었다.