L'Handball Trophy 2005-2006 è stata la 2ª edizione del torneo di pallamano riservato alle squadre partecipanti nella stagione corrispondente alla Serie A Élite.
Esso è stato organizzato dalla FIGH, la federazione italiana di pallamano.
Il torneo è stato vinto dalla Bologna United Handball per la 1ª volta nella sua storia.
Gli incontri si sono disputati a Bressanone in provincia di Bolzano.
La competizione prevedeva la disputa di due gironi eliminatori da quattro squadre ciascuno con la formula del girone all'italiana con incontri di sola andata; a seguire semifinali e finali.