Nel 1554 pubblicò una traduzione, completata nel 1561 e dedicata a Enrico II, in ottave delle Metamorfosi di Ovidio sotto il nome di De le Metamorfosi d'Ovidio libri III di Giovanni Andrea dell'Anguillara. Tornò quindi in Italia, presso la corte di Cosimo de' Medici.
Opere
Anfitrione, commedia, 1548
De le Metamorfosi d'Ovidio libri III di Giovanni Andrea dell'Anguillara, 1554-1561
Edipo, tragedia, 1556
Canzone all'illustrissimo et eccellentissimo Signore Duca di Ferrara, 1562
Canzone di Giovanni Andrea dell'Anguillara alla Serenissima Principessa di Fiorenza, 1566
Capitolo di M. G. Andrea de l'Anguillara al cardinal di Trento, 1545
Nuovi argomenti, fatti da m. Giovan'Andrea dell'Anguillara sopra l'Orlando furioso, di m. Lodovico Ariosto, 1570
Il primo libro della Eneida di Vergilio, ridotto da Giovanni Andrea Dell'Anguillara in ottava rima, 1564