Membre du Parti socialiste à partir de 2005, il est conseiller du 4e arrondissement de Paris de 2014 à 2020, et adjoint au maire de 2014 à 2017. Il rejoint En marche ! devenu La République en marche (LREM), dès sa création en 2016, et y occupe le poste de chargé de la mobilisation, coordonnant notamment la « Grande marche » du parti.
Il travaille en cabinet de recrutement, puis rejoint le groupe SOS où il est chef de cabinet du délégué général Jean-Marc Borello à partir de 2010[4],[5].
Il est professeur de cours particulier en 2012 et 2013 pour Cap enseignement supérieur[6].
Il crée ensuite Babel31, une agence de conseil en communication à destination des entreprises et associations, qu'il vend en 2016, lorsqu'il rejoint En marche[7],[6].
Il est par ailleurs engagé au sein de plusieurs associations, notamment dans la lutte contre l’homophobie et dans le secourisme[7].
Depuis janvier 2023, il est directeur général de la Fondation Le Refuge[8],[9].
En 2014, Pacôme Rupin est élu à la mairie du 4e arrondissement de Paris sur la liste PS conduite par Christophe Girard, et devient adjoint au maire[14],[15]. Il démissionne de ses délégations en , lorsqu'il est investi candidat aux législatives[4], mais reste conseiller d'arrondissement[16].
Dès sa création en , il rejoint En marche et, sur sollicitation d'un membre du cabinet d'Emmanuel Macron, y occupe le poste de chargé de la mobilisation, qui couvre la coordination d'actions de terrain et la formation des adhérents[4]. En , il est notamment chargé de coordonner la « Grande marche » du parti[4]. Il est salarié du parti de à , puis continue d'y travailler comme bénévole[4].
Il fait partie des nouveaux députés LREM issus du milieu de l'entreprise et séduits par le côté « start-up » d’En marche : ils assument vouloir transposer les règles de l’entreprise à l’exercice de leur mandat politique et ont eux-mêmes imprégné le fonctionnement de LREM de leurs méthodes et de leur vocabulaire[18],[19].
Vice-président du groupe La République en marche chargé de la cohésion du groupe sous la présidence de Richard Ferrand, il anime à partir de un « laboratoire d’innovation politique », composé d’une trentaine de députés, qui doit expérimenter de nouvelles méthodes de travail après les difficultés éprouvées durant l'été[20]. Il est proche de Richard Ferrand[21] et de Gilles Le Gendre[5], présidents successifs du groupe LREM.
En , il annonce voter contre le projet de loi sur le pass sanitaire, estimant qu'il constitue une « atteinte majeure à la liberté d'aller et de venir »[23], et démissionne de son poste de whip de la commission des lois[24].
Il ne se représente pas aux élections législatives de juin 2022[25].
Élections municipales de 2020 à Paris
En vue des élections municipales de 2020 à Paris, il devient secrétaire général de l'association Avec Benjamin Griveaux[6] et coordonne un comité de pilotage de 12 personnes mis en place pour préparer la campagne de LREM[26], puis devient directeur de campagne de Benjamin Griveaux après sa désignation par la commission nationale d'investiture du parti[27],[28]. Pacôme Rupin est tête de liste LREM dans le nouveau secteur Paris Centre rassemblant les quatre premiers arrondissements de Paris[29]. Il promet de démissionner de son mandat de député s'il est élu maire de cet arrondissement[30]. Au second tour, sa liste arrive en troisième position dans l'arrondissement avec 14 % des voix[31], et il en est le seul élu conseiller d'arrondissement[32].