Le Naturaliste est une gabarefrançaise de la classe Salamandre lancée en 1795 sous le nom de la Menaçante. Elle est baptisée Le Naturaliste en 1800 et commandée par Emmanuel Hamelin, alors capitaine de frégate. Ce fut l'un des deux principaux navires grâce auxquels le capitaine Nicolas Baudin conduisit son expédition aux Terres australes au départ du Havre le . Elle fut de retour au Havre en .
Le 18 octobre, le navire tenta une sortie du port sur les ordres de Nicolas Baudin, qui craignait de ne pas profiter de l'eau qui lui avait manqué lors de la marée du 7 octobre. Il dut revenir au vieux bassin vers dix heures à cause des vents contraires. Le lendemain, en revanche, il parvint à quitter Le Havre sans effort suivi du Géographe et d'une corvette américaine ramenant des ambassadeurs des États-Unis dans leur pays[3].
Le 25 octobre, le temps devint rude et une inondation eut lieu dans la chambre de Jean-Baptiste Bory de Saint-Vincent, qui dut déplacer sa couche ailleurs. À compter de ce moment, Le Naturaliste présenta du mal à suivre Le Géographe, qu'il perdit de vue vers deux heures du matin. Pour se faire rattraper, Nicolas Baudin fit carguer une partie des voiles de son propre vaisseau et les maintint ainsi durant la suite de l'expédition[3].
Traversée vers Ténérife
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Des Canaries au cap de Bonne-Espérance
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De l'Île de France à la Nouvelle-Hollande
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Voyage de retour
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: Le Naturaliste se sépare du Géographe à l'île King (actuelle Tasmanie) pour rapporter les premières collections en France[4]
Jean-Michel Roche, Dictionnaire des bâtiments de la flotte de guerre française de Colbert à nos jours (1671-1870), tome I, 2005, (ISBN978-2-9525917-0-6). OCLC 165892922.
Expédition Baudin
François Péron, Voyage de découvertes aux Terres Australes, exécuté par ordre de sa Majesté, l’Empereur et Roi, sur les corvettes le Géographe, le Naturaliste et la goëlette le Casuarina, pendant les années 1800, 1801, 1802, 1803 et 1804 : Livre I, de France à l'Île-de-France, inclusivement, t. 1er, Paris, Imprimerie impériale, , 1re éd., 496 p. (lire en ligne).
François Péron et Louis Claude de Saulces de Freycinet, Voyage de découvertes aux Terres Australes, exécuté par ordre de sa Majesté, l’Empereur et Roi, sur les corvettes le Géographe, le Naturaliste et la goëlette le Casuarina, pendant les années 1800, 1801, 1802, 1803 et 1804 : Livre I, de France à l'Île-de-France, inclusivement, t. 1er, Paris, Arthus Bertrand, , 2e éd., 400 p. (lire en ligne).
François Péron et Louis Claude de Saulces de Freycinet, Voyage de découvertes aux Terres Australes, exécuté par ordre de sa Majesté, l’Empereur et Roi, sur les corvettes le Géographe, le Naturaliste et la goëlette le Casuarina, pendant les années 1800, 1801, 1802, 1803 et 1804 : Livre III, de Timor à Port Jackson inclusivement, t. 2e, Paris, Arthus Bertrand, , 2e éd., 532 p. (lire en ligne).
François Péron et Louis Claude de Saulces de Freycinet, Voyage de découvertes aux Terres Australes, exécuté par ordre de sa Majesté, l’Empereur et Roi, sur les corvettes le Géographe, le Naturaliste et la goëlette le Casuarina, pendant les années 1800, 1801, 1802, 1803 et 1804 : Livre IV, de Port Jackson à la Terre d'Arnheim, t. 3e, Paris, Arthus Bertrand, , 2e éd., 432 p. (lire en ligne).
François Péron et Louis Claude de Saulces de Freycinet, Voyage de découvertes aux Terres Australes, exécuté par ordre de sa Majesté, l’Empereur et Roi, sur les corvettes le Géographe, le Naturaliste et la goëlette le Casuarina, pendant les années 1800, 1801, 1802, 1803 et 1804 : Suite du Livre IV, de Port Jackson à la Terre d'Arnheim, inclusivement retour en Europe, t. 4e, Paris, Arthus Bertrand, , 2e éd., 356 p. (lire en ligne).
Louis Claude de Saulces de Freycinet, Voyage de découvertes aux Terres Australes, exécuté par ordre de sa Majesté, l’Empereur et Roi, sur les corvettes le Géographe, le Naturaliste et la goëlette le Casuarina, pendant les années 1800, 1801, 1802, 1803 et 1804 : Navigation et géographie, Paris, Imprimerie royale, , 2e éd., 576 p. (lire en ligne).