Il est très présent dans les controverses théologiques et ecclésiastiques. Dans son Tartuffe épistolaire démasqué, il prouve qu’une lettre attribuée à Clément XIV est l'œuvre d’un ex-prêtre de l'Oratoire, Luigi Caraccioli. Il est l'auteur d'un pamphlet antiprotestant, Discours à lire au Conseil, en présence du Roi, par un ministre patriote, sur le projet d’accorder l’Etat Civil aux Protestants, sl, 1787, appelé familièrement "Mémoire de madame de Noailles" (car elle se chargeait de « le porter aux membres du Conseil et du Parlement »[3]).
Il s'installe ensuite à Paris où il écrit pamphlets et tracts défendant les droits de l'Église et s'opposant à la constitution civile du clergé, qu'il refuse de signer. Arrêté vers le , il est enfermé à la prison des Carmes de Paris, où il est massacré par les sans-culottes, en compagnie de beaucoup d’autres prêtres et religieux, lors des massacres de Septembre, le .
↑Inventaire sommaire des archives départementales antérieures à 1790, 1891, p. 42. Numérisé.
↑Charles Garrisson et Ch. R., « L'abbé Bonnaud et le “Mémoire d'un Ministre patriote” », Bulletin historique et littéraire (Société de l'Histoire du Protestantisme Français), 41, 15 novembre 1892, p. 611.
↑Et non Harnicourt. « Prise de possession du prieuré d'Arnicourt, au diocèse de Reims, dépendant de l'abbaye de Saint-Benoit-sur-Loire, pour Jacques-Jules Bonnaud, vicaire général du diocèse de Lyon. »Inventaire-sommaire des Archives départementales antérieures à 1790: Marne, Archives ecclésiastiques, série G, clergé séculier, 1900, p. 376.
Publications
LeTartuffe Epistolaire Demasque: Ou Epitre Tres-Familiere A M. Le Marquis Caraccioli..., Liège, 1777. Numérisé.
Discours à lire au Conseil, en présence du Roi, par un ministre patriote, sur le projet d’accorder l’Etat Civil aux Protestants, sl, 1787.
Découverte importante sur le vrai système de la constitution du clergé, décrétée par l'Assemblée nationale, 1790. Numérisé sur gallica.
Hérodote, historien du peuple Hébreu, sans le savoir, Liège, 1790 (2nde édition). Numérisé.
Bibliographie
H. Fouqueray: Un groupe de martyrs de . Vingt-trois anciens Jésuites, Paris, 1926.
Charles Garrisson et Ch. R., « L'abbé Bonnaud et le “Mémoire d'un Ministre patriote” », Bulletin historique et littéraire (Société de l'Histoire du Protestantisme Français), 41, 15 novembre 1892, p. 611-616. Numérisé.
Joseph Grente: Les martyrs de , à Paris, Paris, 1926.