Genomoviridae

Genomoviridae

Classification ICTV

Realm	Monodnaviria
Règne	Shotokuvirae
Embranchement	Cressdnaviricota
Classe	Repensiviricetes
Ordre	Geplafuvirales

Famille

Genomoviridae
ICTV 2015^[1]

Les Genomoviridae sont une famille de virus de l'ordre des Geplafuvirales qui comprend neuf genres et 76 espèces. Ce sont des virus à ADN simple brin classés dans le groupe II de la classification Baltimore, qui infectent principalement les animaux vertébrés et invertébrés, mais aussi les champignons. Certaines espèces ont été isolées des eaux usées.

Les virus de cette famille ont un génome de petite taille (2,2 à 2,4 kilobases de longueur). Ce sont des génomes constitués d'ADN simple brin circulaire, codant des protéines d'initiation de réplication circulaire (Rep) et des protéines de capside uniques. Dans les phylogénies basées sur les Rep, les Genomovirus forment un clade frère des virus végétaux de la famille des Geminiviridae^[2],[3].

Étymologie

Le nom de la famille, « Genomoviridae », est un acronyme dérivé de « GEminivirus-like, NO MOvement protein »^[2].

Liste des genres

Selon NCBI (20 décembre 2020)^[4] :

• Gemycircularvirus – 43 espèces
• Gemyduguivirus – 1 espèce
• Gemygorvirus – 5 espèces
• Gemykibivirus – 16 espèces
• Gemykolovirus – 2 espèces
• Gemykrogvirus – 3 espèces
• Gemykroznavirus – 1 espèce
• Gemytondvirus – 1 espèce
• Gemyvongvirus – 1 espèce

Notes et références

1. ICTV. International Committee on Taxonomy of Viruses. Taxonomy history. Published on the Internet https://talk.ictvonline.org/., consulté le 24 janvier 2021
2. (en) Mart Krupovic, Said A. Ghabrial, Daohong Jiang & Arvind Varsani, «  Genomoviridae: a new family of widespread single-stranded DNA viruses », Archives of Virology, vol. 161,‎ 2016, p. 2633–2643 (DOI 10.1007/s00705-016-2943-3, lire en ligne).
3. (en) Arvind Varsani et Mart Krupovic, « Sequence-based taxonomic framework for the classification of uncultured single-stranded DNA viruses of the family Genomoviridae », Virus Evolution, vol. 3, n^o 1,‎ 2017, vew037 (DOI 10.1093/ve/vew037, lire en ligne).
4. NCBI, consulté le 20 décembre 2020

Liens externes

• (en) Référence ICTV : Genomoviridae (consulté le 24 janvier 2021)
• (en) Référence NCBI : Genomoviridae (taxons inclus) (consulté le 20 décembre 2020)
• (en) « Genomoviridae », sur ViralZone (consulté le 20 décembre 2020).
• (en) Mart Krupovic, Said A. Ghabrial, Daohong Jiang & Arvind Varsani, «  Genomoviridae: a new family of widespread single-stranded DNA viruses », Archives of Virology, vol. 161,‎ 2016, p. 2633–2643 (DOI 10.1007/s00705-016-2943-3, lire en ligne).