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Les DRAAF ont été créées et sont régies par le décret no 2008-1406 du . Elles se substituent aux directions régionales de l'Agriculture et de la Forêt (DRAF) créées par décret du , à la suite des lois de décentralisation et de déconcentration de 1982. Elles sont sous l'autorité fonctionnelle du préfet de région et hiérarchique du ministre de l'agriculture.
FranceAgriMer, office agricole rattaché au ministère, chargé d'actions de promotion, d'animation, de valorisation et de dynamisation des filières agricoles et sylvicoles